丛集性发作可持续数周乃至数月后缓解，一般1年发作1～2次，有的患者发病有明显季节性，以春秋季多见。CH缓解期可持续数月至数年，本病60岁以上患者少见，提示其病程有自行缓解倾向。
一、药物治疗
1、甲氧氟烷：
此药是速效麻醉剂，用此药10～15滴滴于手帕上吸入几秒钟可使疼痛缓解。
2、舒马普坦（舒马坦））
连服10～14天，舒马普坦（舒马坦））是5-HT受体激动药与5-HT受体结合，从而抑制5-HT的扩血管作用，使血管收缩达到治疗目的。可以口服滴鼻皮下或静脉注射1～2mg/次，每天不超过6mg，用药后如出现胸闷、胸部发紧应立即停用。
3、泼尼松
丛集发作时口服泼尼松，20～40mg/d或甲泼尼龙（甲基泼尼松龙）静脉滴注200mg/d，至丛集发作停止后停药。
4、麦角胺
因本病发病迅速，头痛剧烈，口服吸收较慢，应用气雾剂吸入有效。剂量0.36～1.08毫克 （吸入1～3次），吸入后5分钟内血浆浓度达到高峰，80%的病人疼痛便缓解。
有些病人静脉注射双氢麦角胺在5分钟内可使疼痛缓解。
5、睾丸素
25mg，肌内注射，1次/d，连用7～10日后改为10mg/d，再用7～lO日，80%的患者可获得显著疗效。
6、碳酸锂
600～900mg/d，对一些慢性病例有效，但需经常监测血锂浓度，使之保持于0.7～1.2mEq/L。有时锂盐可与钙通道拮抗剂维拉帕米合用。锂盐的毒性反应常见恶心、呕吐、心率加快、视物模糊、震颤、肌束颤动和手足徐动等。
7、萘普生
250～500mg，2次/d;甲氯灭酸钠100～200mg，1h内反复应用。
8、心得安
可消除患者的焦虑症状。用法是心得安20毫克，每日3～4次，可逐渐增加到80毫克，每天3次。
二、药物治疗无效或效果不佳时，可以采用下面的方法。
1、通过面罩吸入100%的氧，流量8～10升/分，吸入10～15分钟，80%的病人头痛可以明显好转。
2、组胺脱敏治疗对部分患者有效。
3、神经阻滞疗法如利多卡因蝶腭神经节阻滞，眶上神经或眶下神经酒精注射，射频三叉神经节阻滞。