急性肾盂肾炎治疗时宜尽早控制感染，却除诱发肾盂肾炎的不良因素和对症处理。
五种急性肾盂肾炎的治疗方法：
(1)超短波疗法
①肾区：适用于急、慢性肾盂肾炎。方法是：将两个板状电极置于肾区，即肋脊角与肋腰角之间的区域，前后对置，无至微热量。每次10～15分钟，每日1次，5～10次为1疗程。急性期伴高热时剂量不宜过大。
②膀胱区：当膀胱刺激征(尿频、尿急、尿痛)明显时，可将电极置于下腹部膀胱区，前后对置;或一个电极置于肾区，另一个电极置于下腹部膀胱区，即斜对置。剂量、时间同上。
(2)微波疗法：有条件时可采用微波辐射疗法，适用于慢性肾盂肾炎。方法是以圆形辐射器置于肾区，距离10～15cm，剂量50～100瓦。每次5～10分钟，每日1次，10次为1疗程。
(3)红外线和TDP疗法：肾区照射法。微至温热量。每次20～30分钟。用于慢性肾盂肾炎效好。
(4)紫外线疗法：对于反复发作的慢性肾盂肾炎无肾功能不全的病人，采用肾区紫外线照射，有一定的治疗作用。其剂量可用Ⅰ～Ⅱ级红斑量，每日1次，5～10次为1疗程。
(5)蜡疗：温热作用可改善肾脏血液循环，并能增强药物的消炎作用。方法是用蜡袋或蜡饼敷于双肾区。每次30分钟，每日1次，15次为1疗程。
几个治疗肾盂肾炎的方案
1.无症状性菌尿的治疗方案：慢性肾盂肾炎，尤其是孕妇、儿童及有复杂因素存在者，必须治疗。一般口服给药2-6周，用药方法同前述。由于无症状，尿细菌学检查极为重要，应在治疗开始后3-5天，疗程结束后5-9天及疗程结束后4-6周分别作中段尿细菌培养，以观疗效，低剂量长程疗法可能有益。
2.L型菌尿路感染的治疗方案：球菌、杆菌和真菌均可演变为L型菌尿，慢性反复发作的尿路感染患者中段尿普通培养无菌生长，约20%是L型细菌所致。关于L型菌慢性肾盂肾炎的治疗，可针对L型细菌的特点及病人的具体情况，选用抑制菌细胞内蛋白合成的红霉素、四环素及土霉素，亦可选用破坏细胞膜表面磷脂的抗生素如多粘菌素B、氨基糖苷类、氯霉素等均有作用，通常疗程为6-8周。在用药治疗中应特别强调正规、足量，同时要选用对L型菌有作用的药物，已达到控制病情反复迁延的目的，要注意多饮水，以降低髓质区渗透压，抑止L型细菌生存。
3.一般治疗：通常应鼓励患者多饮水，勤排尿，以降低髓质渗透压，提高机体、吞噬细胞功能，有发热等全身感染症状者应卧床休息，服用碳酸氢钠1g，每日3次，可碱化尿液，以减轻膀胱刺激症状，并对氨基糖甙类抗生素、青霉素、红霉素及磺胺等有增强疗效的作用，但应注意碱化尿液可使四环素死亡药效下降。有诱发因素者应予积极治疗，如肾结石、输尿管畸形等。抗感染治疗最好在尿细菌培养及药物敏感实验指导下进行。