慢性细菌性结膜炎可由急性结膜炎演变而来，或毒力较弱的病原菌感染所致。多见于鼻泪管阻塞或慢性泪囊炎病人，或慢性睑缘炎或睑板腺功能异常者。金黄色葡萄球菌和摩拉克菌是慢性细菌性结膜炎最常见的两种病原体。
根据临床表现、分泌物涂片或结膜刮片等检查，可以诊断。结膜刮片和分泌物涂片通过Gram和Giemsa染色可在显微镜下发现大量多形核白细胞和细菌。为明确病因和指导治疗，对于伴有大量脓性分泌物者、结膜炎严重的儿童和婴儿，及治疗无效者应进行细菌培养和药物敏感试验，有全身症状的还应进行血培养。
慢性结膜炎的症状主要有：
发病急，自觉流泪、异物和烧灼感。检查眼睑、结膜水肿，结膜充血，有脓性或粘液性分泌物，常使上下睫毛粘在一起，早晨起床时睁眼困难。细菌性慢性结膜炎严重者眼睑红肿，睑结膜出现灰白色膜，能擦去但易再生，称为假膜；病毒性慢性结膜炎分泌物多呈水样或粘性，出现感冒样症状，球结膜下小出血点，伴同侧耳前淋巴结肿大、压痛；过敏性慢性结膜炎分泌物清稀，或呈粘液样、丝状，有明显的痒感，眼睑、结膜水肿明显，常能寻找出过敏原因。
慢性结膜炎多是双眼先后发病，患病早期，病人感到双眼发烫、烧灼、畏光、眼红，自觉眼睛磨痛，像进入沙子般地滚痛难忍，紧接着眼皮红肿、眼眵多、怕光、流泪，早晨起床时，眼皮常被分泌物粘住，不易睁开。有的病人结膜上出现小出血点或出血斑，分泌物呈粘液脓性，有时在睑结膜表面形成一层灰白色假膜，角膜边缘可有灰白色浸润点，严重的可伴有头痛、发热、疲劳、耳前淋巴结肿大等全身症状。
慢性结膜炎一般不影响视力，如果大量粘液脓性分泌物粘附在角膜表面时，可有暂时性视物模糊或虹视（眼前有彩虹样光圈），一旦将分泌物擦去，视物即可清晰。如果细菌或病毒感染影响到角膜时，则畏光、流泪、疼痛加重，视力也会有一定程度的下降。
慢性结膜炎发病急，一般在感染细菌1～2天内开始发病，且多数为双眼发病。传染性强，本病由于治愈后免疫力低，因此可重复感染（如再接触病人还可得病），从几个月的婴儿至八九十岁的老人都可能发病。流行快，患慢性结膜炎后，常常是一人得病，在1～2周内造成全家、幼儿园、学校、工厂等广泛传播，不分男女老幼，大批病人感染。
那么，怎样鉴别慢性结膜炎与颈动脉海绵窦瘘引起的眼红呢？
对于眼红患者，如有头部外伤史、搏动性眼球突出、耳鸣（和眼球搏动的节律一致）、球结膜水肿充血、眼球运动障碍、视力下降，有符合任何一项的就应该考虑为非结膜炎所致。最明显的一点是，患慢性结膜炎时眼内分泌物特别多，且传染性强，多为单眼发作，很快双眼同时发病；而颈动脉海绵窦瘘患者的眼内无脓性分泌物，一般是头部伤侧单眼发作，不会传染。