胃肠型食物中毒的潜伏期短，常于进食后数小时发病。各型病原菌或其毒素引起胃肠型食物中毒的临床表现很相似，主要为腹痛、腹泻、呕吐等胃肠炎症状。一般起病急，腹部不适，上、中腹部持续或阵发性绞痛，恶心、呕吐。呕吐物多为胃内容物。病程短，多在1~3d内恢复。
①沙门菌引起的食物中毒：病程3~5d，偶可达1~2周。发热多不严重，腹痛、腹泻程度不一，轻者肠蠕动增强伴糊状大便，重者肠绞痛伴水样泻，偶有黏液或血便，其中伤寒沙门菌者则以腹泻、高热为主，脓血便多见。
②副溶血弧菌引起的食物中毒：病程为1~6d不等，可自限，一般恢复较快。腹痛多为阵发性绞痛，常位于上腹部、脐周或同盲部，腹泻次数不等，大便性状多样，多数为黄水样或黄糊状.2%~16%呈典型的血水或洗肉水样，由下吐泻，常有脱水，严重者血压下降，以致意识不清。该菌产生的溶血素为一种特异性心脏毒素，可引起心房纤颤，早搏或心肌损害。近年来报道的临床表现不一，可呈典型的胃肠炎型、菌痢型、中毒性休克型或少见的慢性肠炎型。
③O157：H7肠出血性大肠杆菌感染：病程为7~9d，也有长达12d者，可有无症状带菌、非血性腹泻、出血性结肠炎以及溶血性尿毒综合征，主要表现为突然发生的剧烈腹痛和非血性腹泻，数天后出现血性腹泻，无粪质，白细胞计数可增高，感染一周后可发生严重的溶血尿毒综合征，并可出现窦性心动过缓、惊厥、血小板减少性紫癜等并发症。
④葡萄球菌或蜡样芽孢菌食物中毒：一般于数小时或1~2d内迅速恢复。起病急骤，有呕吐、中上腹痛和腹泻，呕吐为最显著的症状，呕吐物可呈胆汁或含血及黏液。剧烈吐泻常导致虚脱，肌肉痉挛及严重失水，体温多正常或略高。
⑤变形杆菌食物中毒：多为自限性，于1~2d内恢复。该菌产生的肠毒素可使蛋白质中的组氨酸脱羧形成组胺而引起胃肠炎，腹泻每日数次至10余次，多为水样便，有恶臭，少数带黏液，无脓血。