抗病力及免疫功能低下，菌群失调是重要原因。广谱抗生素应用之后，特别是林可霉素，氯林可霉素，氨基苄青霉素，羟氨苄青霉素等的应用，抑制了肠道内的正常菌群，使难辨梭状芽孢杆菌得以迅速繁殖并产生毒素而致病，本病也可发生于手术后，特别是胃肠道癌肿手术后，以及其他有严重疾病如肠梗阻，恶性肿瘤，尿毒症，糖尿病，心力衰竭，败血症等患者。
这些病例一般抗病能力和免疫能力极度低下，或因病情需要而接受抗生素治疗，机体的内环境发生变化，肠道菌群失调，有利于难辨梭状芽胞杆菌繁殖而致病。难辨梭状芽孢杆菌及其毒素为本病致病因素，但粪中毒素的效价高低与病情的轻重并不平行，由此说明该菌毒素并非影响疾病严重程度的唯一因素。
伪膜性结肠炎是由于使用抗生素不当或使用化学治疗药物而引起的肠道二重感染 ，主要病因菌是艰难梭菌。临床上几乎所有的抗生素都可诱发此病 ，治疗原则是一经诊断明确就应立即停用抗生素 ，因此此病的西医治疗较难实施。我们采用大蒜汁辅以清热燥湿方剂进行调治 ，取得了很好的疗效。
轻型 ：采用大蒜糖浆口服。糖浆制备 ：去皮紫皮大蒜 50克 ，捣碎后浸于 38摄氏度温开水100毫升内浸泡两小时 ，然后用纱布过滤 ，制成大蒜汁 ，再加入半量糖浆 （配制后置 4摄氏度条件下冷藏可保质 1周 ）。成人口服 20～ 30毫升/次 ；儿童口服 5～ 10毫升 /次 ，每天 3次。
中型 （典型 ）：采用大蒜糖浆口服 ，辅以清热燥湿方剂调治。大蒜糖浆用量与轻型相同 ，服用次数增至每 4～ 6时一次 ；清热燥湿方剂 ：椿根皮 15克 ，白头翁 15克 ，黄芩 10克 ，黄连 6克 ，山楂 30克 ，山药 20克 ，扁豆 10克 ，苍术 20克 ，薏苡仁 20克 ，白芨 30克。水煎服。
重型 ：采用大蒜素注射液静脉滴注。用法与用量 ：60～ 120毫克 ， 5%葡萄糖液 500～ 1000毫升稀释后滴注 ，每天 1次。病程较长者采用大蒜液灌肠法治疗。大蒜灌肠液制备 ：大蒜汁10毫升、诃子黄连汁 （诃子 10克、黄连 10克 ，加水煎熬并使之浓缩至 50～ 100毫升 ）25～ 50毫升 ，加生理盐水至 100毫升。用法 ：大蒜灌肠液经水浴加温至 37～ 38摄氏度 ，于 10分钟内缓缓注入肛门内。嘱患者忍耐 15～ 30分钟后排便。每天 1～ 2次 ， 6～ 10次为一疗程。注射治疗、灌肠治疗的同时辅以口服清热燥湿方剂调治。 结果 ：1周内有效率为 64。 1%，痊愈率为46。 2%；两周内累计有效率为 87。 2%，痊愈率为 89 。 7%；3周内累计有效率为 100%，痊愈率为 9 7。 4%。