慢性肾功能衰竭是一个慢性疾病，和绝大多数的慢性疾病一样，其发展过程相对长，而此病在不同的时期里面显示出不同的特点，诊断的时候不仅仅要确定疑似患者是否患有此病，还需要确定病患者处于慢性肾功能衰竭的哪个阶段，以便有针对性地制定治疗方法。还有增加一些附加检查，确定患者是否患有其他慢性疾病，特别是高血压和糖尿病，降低治疗的风险。
诊断标准：
1、肾功能代偿期
肾小球滤过率（GFR） ≥正常值1/2时，血尿素氮和肌酐不升高、体内代谢平衡，不出现症状（血肌酐（Scr）在133～177μmol/L（2mg/dl））。
2、肾功能不全期
肾小球滤过率（GFR）<正常值50%以下，血肌酐（Scr）水平上升至177μmol/L（2mg/dl）以上，血尿素氮（BUN）水平升高>7.0mmol/L（20mg/dl），病人有乏力，食欲不振，夜尿多，轻度贫血等症状。
3、肾功能衰竭期
当内生肌酐清除率（Ccr）下降到20ml/min以下，BUN水平高于17.9～21.4mmol/L（50～60mg/dl），Scr升至442μmol/L（5mg/dl）以上，病人出现贫血，血磷水平上升，血钙下降，代谢性酸中毒，水、电解质紊乱等。
4、尿毒症终末期
Ccr在10ml/min以下，Scr升至707μmol/L以上，酸中毒明显，出现各系统症状，以致昏迷。
诊断方法：
1、常用的实验室检查
项目包括尿常规、肾功能、24小时尿蛋白定量、血糖、血尿酸、血脂等以及血电解质（K，Na，Cl，Ca，P，Mg等）、动脉血液气体分析、肾脏影像学检查等。
检查肾小球滤过功能的主要方法有：检测血清肌酐（Scr）、肌酐清除率（Ccr）、放射性核素法测GFR等。我国Ccr正常值为：90±10ml/min。对不同人群来说，其Scr、Ccr值可能有显著差别，临床医师需正确判断。
2、影像学检查
一般只需做B型超声检查，以除外结石、肾结核、肾囊性疾病等。某些特殊情况下，可能需做放射性核素肾图、静脉肾盂造影、肾脏CT和磁共振（MRI）检查等。肾图检查对急、慢性肾衰的鉴别诊断有帮助。如肾图结果表现为双肾血管段、分泌段、排泄功能均很差，则一般提示有CRF存在；如肾图表现为双肾血管段较好，排泄功能很差，呈“梗阻型”（抛物线状），则一般提示可能有急性肾衰竭存在。
MRI检测肾功能的优势
Gd-DTPA即（二乙三胺五乙酸钆）是MRI常用的造影剂，可完全被肾小球滤出，不能被。肾小管分泌与重吸收，因此，Gd-DTPA的肾清除率可用于衡量肾小球滤过功能。Gd-DTPA通过肾脏的情况可被T1加权的MRI追踪。MRI的高分辨率使检查时可清晰地看到肾血管、肾皮质、髓质与集合系统内的造影剂情况。理论上，如果能确定肾内不同部位中MRI信号强度与Gd-DTPA浓度的关系，就可以通过一系列的公式计算出分肾的肾清除率与肾小球滤过率（GFR），且其敏感性应高于血Cr。
肾皮质的增强反映的是肾灌流与肾小球滤过情况，而髓质与集合系统增强反映的是肾小管情况，两者互不干扰。另外，肾内疾病常只影响肾内某一部分结构。因此，在所有的无创性检查法中，MRI是惟一有可能区分肾小球疾病与肾小管疾病的检查。
同时，MRI检查具有三维显像、分辨率高、显像快、不需碘造影剂、无放射性损害、无创等优点。使用其检测肾功能能够消除其他检查法的缺点。MRI尤其适用于儿童、肾移植术前检查与术后监测等情况。