原发性脑干损伤，是由外部暴力引起的脑干损伤。继发性脑干损伤，继发于其他严重脑损伤，由于脑瘫或脑水肿而引起脑干损伤。临床表现为意识模糊、昏迷、呼吸、心跳骤停等，对于轻度脑干损伤患者，可根据脑挫伤和裂伤进行治疗，部分患者可获得良好效果。严重的原发性脑干损伤伴长期昏迷，长期气管切开，呼吸机辅助呼吸和亚低温治疗。

脑干损伤诊断，原发性脑干损伤往往与脑挫裂伤或颅内出血同时伴发，临床症状相互参错，难以辨明孰轻孰重、何者为主，特别是就诊较迟的病人，更难区别是原发性损伤还是继发性损害。原发性脑干损伤与继发性脑干损伤的区别在于症状、体征出现的早晚。继发性脑干损伤的症状、体征皆在伤后逐渐产生。颅内压持续监护亦可鉴别：原发性颅内压不高，而继发性则明显升高。同时，CT和MRI也是鉴别诊断的有效手段。在显示脑实质内小出血灶或挫裂伤方面，尤其是对胼胝体和脑干的细微损害，MRI明显优于CT。脑干听觉诱发电位可以较准确地反映脑干损伤的平面及程度。通常在听觉通路病灶以下的各波正常，病灶水平及其上的各波则显示异常或消失。颅内压监护连续测压亦有鉴别原发性或继发性脑干损伤的作用，虽然二者临床表现相同，但原发者颅内压正常，而继发者明显升高。

临床表现：本病潜伏期约为1一3周。Nipah病毒感染可引起严重的迅速进展的脑炎，病死率很高，临床表现与脑干损伤有关。感染Nipah病毒后主要表现为发热、头痛、眩晕、呕吐、不同程度的意识模糊和明显的脑干功能失调。神经系统表现多样，包括无菌性脑炎、弥散性脑炎和脑干症状。具有鉴别意义的临床症状包括节段性肌阵挛、无反射和肌张力低下、低血压和心动过速，提示脑干和上段颈脊髓索受损;异常的doll’s眼反射和心动过逮与预后不良有关。死亡可能与严重的脑干损伤有关。