目前对轮状病毒性肠炎尚无特效药物，因本病多为病情轻，病程短，呈自限性，故主要根据急性腹泻的治疗原则采取对症治疗。如纠正脱水及时补充水分，另外要注意的是，抗菌治疗对轮状病毒性肠炎无效，也不要多加服用抗生素，否则会有反作用。对于腹泻者，可口服补液盐溶液（ORS）配方纠正和防止脱水。
1、预防脱水，口服补液盐
腹泻时，孩子会有频繁的水样便，大便稀薄、色淡，有时呈白色米汤样或清水样。反复的腹泻会使孩子体内水分丢失，为了预防孩子脱水，可以给患儿饮用高效又价廉的口服补液盐（简写ORS，各医院和大药房都有出售）。孩子每排便一次，服ORS约50—100毫升，可起到预防脱水的作用。
2、重度脱水患者注意补液
成人用量：开始输注5%葡萄糖盐水1000ml，或10%葡萄糖液500ml、0.9%氯化钠液500ml，以后的用量根据脱水程度、血压脉搏而定。待血压回升后给3：2：1溶液（10%葡萄糖3份、0.9%氯化钠2份、1.4%碳酸氢钠液1份）患者有尿后加氯化钾液，浓度在3‰以内。其量在500～1000ml。儿童患者人院24h总输液量按脱水程度以每公斤体重计算，轻度100～150ml，中度150～200ml。重度200～250ml。仍未见尿加钾，浓度在3‰以内。
3、微生态制剂
疗效较好的制剂有培菲康、丽珠肠乐、金双歧 ，属双歧杆菌制剂。
4、注意胃肠黏膜保护剂
常用的是双八面蒙托石粉 ，如肯特令和蒙托石 （思密达 ），是目前专家推荐的治疗小儿性肠炎的有效药物。用量：不足1岁 ，每天 1包 ；1～ 2岁 ，每天 1～ 2包 ；2～ 3岁 ，每天 2～ 3包。分 3次加温水 50毫升口服。
5、勿滥用抗生素
病毒性腹泻的“肇事者”是轮状病毒和腺病毒，它跟其它病毒一样，不怕抗生素，使用抗生素只会适得其反。如果对腹泻的孩子滥用抗生素，不仅会消灭肠道里正常的细菌，引发菌群失调，影响肠道的吸收功能，而且细菌耐药菌株不断增多，还可继发霉菌性肠炎等，使腹泻迁延或加重。
6、观察大便，认真冲洗
观察孩子大便的次数、量及性状，看病情是否有变化。护理患儿前后，家长都要认真洗手，防止交叉感染；患儿每次大便后应及时更换尿布，并用温开水冲洗肛门及周围，预防发生臀红及泌尿系感染。如果已经形成臀红，可涂鞣酸软膏、鱼肝油、氧化锌软膏等。
7、清淡饮食，无需禁食
一般不需要禁食，即便要禁食，也不宜超过6-7小时。因为禁食可能会导致孩子饥饿性腹泻，出现脱水和电解质紊乱。不利于孩子肠胃的修复。治疗要点就是继续喂食，吃母乳的孩子，可少吃多餐；人工喂养的孩子，吃减少或无乳糖的奶粉，或已经稀释过的牛奶；而已添加辅食的孩子可吃稀粥或面条。一般来说，秋季腹泻的病程有5-7天，这期间不用禁食也不用进补，关键在于清淡好吸收。
8、避免交叉感染
发现腹泻患儿和带菌者要隔离治疗，粪便应做消毒处理。