反应性关节炎的发病诱因、病情程度及复发倾向因人而异。因此，治疗上应强调个体化及规范化的治疗。部分反应性关节炎患者反复发作，长达10余年。少数病人可发生关节强直、主动脉关闭不全、心脏传导阻滞和IgA肾病等。因此，一定不能掉以轻心。
反应性关节炎的一般治疗
反应性关节炎患者应适当休息，减少受累关节的活动，但又不应当完全制动，以避免失用性肌肉萎缩。
反应性关节炎的用药
1、外用消炎镇痛乳剂及溶液等对缓解关节肿痛有一定作用。
2、非类固醇抗炎药（NSAIDs）为反应性关节炎的首选药物。根据关节炎的程度不同，可选择性给予双氯芬酸、萘丁美酮（瑞力芬）、罗非昔布、塞来昔布（西乐葆）。其他NSAIDs如美洛昔康（莫比可）、舒林酸（奇诺力）、布洛芬（芬必得）等也可选用。但是，用药过程中应定期复查血常规及肝转氨酶，避免药物引起的不良反应。应用NSAIDs无明显效果，而且症状严重的关节炎患者，可给予小剂量泼尼松，短期应用，症状缓解后尽快减量。在泼尼松减量过程中加用NSAIDs，有利于症状的控制。
3、在合并虹膜炎或虹膜睫状体炎的反应性关节炎患者应及时口服泼尼松，并给予盐酸环丙沙星滴眼液（悉复明）、可的松眼液滴眼。
近几年的研究表明，慢作用抗风湿药（SAARDs）对反应性关节炎有较好的治疗作用。
反应性关节炎的注射治疗
关节腔穿刺抽取关节液后，腔内注射倍他米松（得宝松）或醋酸去炎松，对缓解关节肿痛十分有效。但注射间隔不应少于3个月。
在合并虹膜炎或虹膜睫状体炎的反应性关节炎患者，必要时可球后或结膜下注射倍他米松等。同时，应进行眼科检查，以得到及时的专科治疗。
反应性关节炎的抗生素治疗
对于从尿、便及生殖道分离或培养出细菌的患者，应给予对革兰阴性菌敏感的抗生素或根据药敏试验进行治疗。对溶血性链球菌感染引起的反应性关节炎则采用青霉素或红霉素治疗。但是，反应性关节炎患者是否应长期应用抗生素尚无定论。研究证明，一旦出现反应性关节炎，抗生素并不能阻止关节内病理过程。因此，反应性关节炎患者的抗生素治疗的目的在于控制感染，而不是治疗关节炎本身。