角膜移植手术本身仅仅是角膜移植的一部分，术后的处理和自我保健是角膜移植不可忽略的重要内容。
1、定期复查：出院后每周一次，病情无特殊，一个月后，可每月一次，待角膜缝线拆除后，每三个月复查一次，以减少术后远期并发症。用药指南：典必殊眼药水，每天4次；1%环孢霉素眼药水，每天4次；典必殊眼药膏，每天睡前一次。1个半月后每天3次，3月后每天2次，2周后再减为1次，4个月后完全停用。
2、角膜缝线拆除的时间：穿透性角膜移植术的缝线一般于术后半年至一年；板层角膜移植一般于术后2~3个月，具体时间复查时由医生确定。
3、注意排斥反应的发生；排斥反应常发生于术后1~2个月，但有些病人术后几年也有发生排斥反应的；因此，如果病人感觉眼红、痛，突然视力下降，角膜移植片混浊，要立即到医院就诊。
4、一般处理方法是：典必殊眼药水，每小时一次；1%环孢霉素眼药水，每2小时一次；典必殊眼药膏，每天睡前一次；球旁注射甲基强的松龙20毫克，每3天一次，或结膜下注射地塞米松注射液2.5毫克（隔天注射一次）；同时用氢化可的松100~200毫克溶在500毫升或1000毫升葡萄糖溶液中静脉滴注。约7天后可根据移植片恢复透明情况，改为口服激素一段时间，眼部继续滴药，但次数逐渐减少。
5、滴眼药水时滴管头不要碰到角膜移植片，两种以上的眼药水要交替使用，每次间隔几分钟，以保证药物在眼内的浓度。滴眼剂宜放于阴凉避光处。
6、饮食指导：适当补充营养，增强机体抵抗力，多吃水果、蔬菜，以保持大便通畅。少吃辛辣、油腻食物。
7、注意活动与休息
注意眼部卫生，不要揉眼；外出要戴防护眼镜，避免碰伤术眼。一年内移植片神经知觉尚未建立，因此无感觉，容易受伤，故要注意避免摩擦。如属于单纯疱疹病毒炎患者，术后要注意预防感冒、上呼吸道炎和过劳，不要吸烟，防止角膜炎复发。