莱姆病是多器官、多系统受累的炎性综合征，且病人可以某一器官或某一系统的反应为主。本病还具有潜伏期长、病程长，早期临床表现和中晚期临床表现可间隔较长时间等特点，因此本病的临床表现复杂，不同病人可以完全不同的临床表现就诊。也因为如此，除目前国际上公认的命名是莱姆病外，还有许多其他命名，如游走性红斑（EM）、慢性游走性红斑（ECM）、慢性萎缩性肌皮炎（ACA）、慢性脑脊髓炎、良性淋巴细胞增生症、慢性游走性红斑性关节炎、少年类风湿性关节炎、莱姆关节炎等。
莱姆病患者常有全身不适，疲乏、头痛、发热、寒战、项强直、关节疼痛、淋巴结肿大和嗜睡等症状。与流感或流感伤寒型钩端螺旋体病的症状相似，常被误认为感冒。乏力是最常见也是病人感觉最突出的症状，患者体温多呈间歇性低烧，儿童可高烧和呈持续性，皮损近心端的淋巴结可肿大，甚至出现全身淋巴结肿大。早期皮肤损害常见，如ECM、致密性红斑、荨麻疹、多发环形红斑，尤以ECM为主要特征，约20%～90%的患者出现ECM。ECM分为原发性和继发性二种。
原发性ECM蜱咬部位出现一红色斑疹或丘疹，一周后（3～32天）渐渐扩大。呈环形向四周移行，其中央呈致密红斑或硬结或疱疹或坏死或在消退前由红色变为蓝色。该环周边鲜红，一般不高出或略高出皮肤，有人形象地把这种典型的ECM称为“牛眼型皮疹”，皮疹的直径在3～68cm之间，平均15cm，大腿、腹股沟、腋下是最为常见的部位，如皮损位于头部，则仅于发际处形成线状损害。皮损部位常有灼热感，偶感疼痛或瘙痒。
继发性ECM原发性ECM发生数天后，约半数人出现继发性ECM。继发性ECM数量可多可少，个别病人竟超过100个。继发性ECM的皮损与原发性ECM类似，但常较小，移行变化不大，缺乏硬结中心。除掌蹠皮肤外，任何部位均能发生，若经有效的抗生素治疗，ECM常在4天左右消退。未经治疗者ECM可持续1月左右（1天～14个月）后消退，但以后仍可复发。冷、热或日光等因素可诱其复发。
由于莱姆病有慢性化倾向，故早期发现、早期治疗，不仅可使病人的早期症状得到改善(如缩短游走性红斑出现的时间)，更重要的是能防止或减轻并发症的发生及防止疾病转变为慢性。很多莱姆病患者在早期症状出现数周或数月后可出现神经系统、循环系统和运动系统受损的症状，少数病人还可有消化系统、呼吸系统、泌尿生殖系统受损的症状，这些症状和体征多呈间歇交替性发作，一段时间内可只以一种症状为主。神经系统症状神经系统的损害以脑膜炎、脑炎、神经根炎、局部颅神经炎最常见，患者因此可出现各种症状。
其他系统症状少数患者有肝炎样症状，如厌食、恶心、呕吐、右上腹痛、肝肿大、肝区压痛、体重减轻等。呼吸道症状以咽痛常见，部分病人有短暂的胸部刺痛，个别人有睾丸肿痛等症状。
