通常，普通的胃肠 炎、阑尾炎，或是一过性的肠痉挛无需进行医学影像学检查。而长时期的腹部隐痛，或是剧烈的腹痛，甚至伴有血尿、休克等就离不开医学影像学的检查了。然而，腹痛所涉及的器官较多，有消化系统、泌尿系统、生殖系统等，仅消化系统在腹部的就有肝、胆、胰、胃肠等。因此，整个腹部的检查将涉及到所有的影像学。
外伤
首先，如果是由于外伤所引起的腹痛，少不了要做超声检查，看看是否有肝脏破裂、脾脏破裂，以及有否腹腔积液和肾脏的问题。其次，就得做CT检查，以证实上述情况的存在。如果考虑有肠穿孔的可能，还得进行X线的站立位腹部平片的检查，看看膈下是否有一轮“弯弯的月亮”，以考虑膈下游离气体的存在，诊断胃肠穿孔的可能性。如果外伤伤及尿道，还得做尿道的X线造影，以明确尿道受伤狭窄情况。
胃肠道检查
如果病人是由于吃饭不规律，常常在饭前，或是饭后所引起的疼痛，可考虑胃或十二指肠球部溃疡的可能性，对于它通常要做上消化道钡餐检查。如果发现溃疡，考虑其癌变，或是直接发现是肿瘤，则需做CT平扫加增强，以明确肿瘤及其与周边的关系，以及是否有远处转移。如果是下消化道的肿瘤，就得做钡剂灌肠，以及前面所说的CT检查。如果是小孩肠套叠，以及手术后，或是肿瘤占位所引起的肠梗阻时，就得做X线的站立位腹部平片检查，看看是否有气、液平的存在，以考虑肠梗阻的可能性。如果是肿瘤引起的肠梗阻，就得做CT平扫加增强，寻找肿瘤所在的位置。
消化腺检查
如果是肝脏的问题，少不了要做超声检查。一旦发现问题，特别是区分肝囊肿、肝血管瘤以及肝肿瘤时，离不开CT的平扫加增强，以及CT的延时扫描，甚至，就连磁共振也得来帮忙检查。如果确诊为肿瘤，还要看看是否有远处转移，就得进行大范围的CT平扫加增强。
如果上腹部疼痛是因为胆囊引起，同样也离不开超声检查，看看是否有胆囊结石，或是胆囊肿瘤。如果是前者，仅需做CT平扫，有时考虑阴性结石，还得进行磁共振的胰胆管成像；如果是后者，又得在CT平扫的基础上进行CT增强扫描。
如果是暴饮、暴食所引起的腹痛考虑有胰腺炎的可能时，需进行CT扫描。如果是考虑胰头癌的可能性时，除了CT平扫加增强外，还要进行超声检查，以及上消化道钡餐检查，看看十二指肠圈有否增大的迹象，以间接判断胰头癌存在的可能性。
泌尿系统检查
如果腹痛是因为有泌尿系统结石所引起的，就得做腹部超声检查、X线平片检查，看看泌尿系统是否有结石存在。倘若考虑阴性结石存在的可能，或是要看看肾脏泌尿功能的情况，还需要进一步进行泌尿系统的X线造影检查。如果泌尿系统的X线造影显示不佳，还得进行逆行性尿路造影。甚至，在考虑结石时，也得做CT平扫。如果考虑肿瘤、结核，或是囊肿、多囊肾，以及泌尿系统畸形时，除了超声和泌尿系统的X线造影外，还得做CT平扫加增强及三维重建，观察肿瘤情况，或是其他变异情况。如果是膀胱结石，需要做膀胱的X线平片检查，甚至是膀胱造影。当然，如果是膀胱癌、膀胱结核，需要做X线膀胱造影检查，以及CT的平扫加增强，甚至是磁共振检查。
生殖系统检查
前列腺检查离不开超声检查、磁共振检查，如果是癌症，还得考虑大范围的CT平扫加增强，以明确受累范围，倘若考虑有骨转移的可能，还得进行核医学的相关检查。如果是育龄妇女，有性生活史，腹痛，甚至出现休克症状时，就得考虑有宫外孕的可能性，此检查少不了超声检查。附件肿瘤的检查少不了要做CT平扫加增强，以及磁共振检查。大凡是肿瘤病人考虑有骨转移时，均离不开全身性的核医学检查。