为了根除病灶，许多患者需要接受131碘治疗，但由于病人对131碘治疗不甚了解而产生了许多顾虑，不知道治疗后的副反应究竟有多大呢，也不知道自己的身体是否能承受这种看似威力巨大的治疗方法。其实这些顾虑都是不必要的。碘131治疗总体上很安全，治疗后，一般只有短暂、轻微胃肠道不适和颈部肿胀、疼痛感，极个别有恶心、腹泻、口干现象。但一般不会引起呕吐、脱发、骨髓和性腺抑制等严重的毒副反应。131碘治疗的副作用要比放化疗小的多，而且大多能及时缓解。主要有以下几点：
1.颈部肿胀：一般表现为颈部无痛性肿胀，发生在服药后24-48小时之内，以术后较多甲状腺组织残留的患者发生为多。大多可自行缓解，严重时需使用糖皮质激素。
2.唾液腺损伤：分为急性与慢性两种。前者一般出现在24小时内，表现为腮腺及颌下腺一过性肿胀和触痛，此时需要患者多喝水、多咀嚼和含服酸性食物以促进唾液分泌；后者一般发生于接受多次大剂量131碘治疗患者，表现为口干、腮腺区疼痛、味觉改变、吞咽困难等，其发生率较低。
3.胃肠道症状：是治疗过程中发生率最高的副作用。一般仅为恶心，呕吐及腹泻较少见，可于服药后几小时即出现，持续2天至1周，常可用止吐剂对症处理。与病人心理恐惧感及轻度胃肠道水肿有关，在治疗前做好心理疏导，随时关心病人情况及清淡饮食即可。严重者需要对症处理。
4.生殖系统的影响：多数学者认为131碘治疗可能导致短暂性卵巢或睾丸功能异常，但之后仍可安全生育。通过医学内照射剂量法（MIRD）计算得出生殖腺所接受的照射剂量低于人类精子的半数致死量（LD50）。世界近千例研究表明未发生影响生育或新生儿先天异常的证据。但为减少性腺照射，建议患者服药后足量饮水并反复排尿。
5.骨髓抑制：一般不会发生，多次治疗后可能发生一过性骨髓抑制而造成白细胞降低，服用升高白细胞药物后多能缓解。
通常不会引起不孕，也不会增加其他肿瘤的发生几率。
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