美国学者Snowberger等的一项研究显示，磁共振成像(MRI)检出肝细胞癌(HCC)的敏感性最强，并可确定HCC体积，甲胎蛋白(AFP)用于筛查HCC尚不够敏感，但AFP对肝病预后具有预测意义。
研究纳入在Baylor地区移植中心接受肝移植手术的患者，比较其接受的AFP、超声、CT、MRI等检查结果与诊断、预后的相关性。
结果显示，共239例患者在肝移植时切下的肝脏组织中证实HCC病变，其中186例（77.8%）在肝移植前已被诊断为HCC。 226例（94.6%）患者同时患有肝硬化，原发肝病病因主要为丙型肝炎（55.2%）、乙型肝炎（16.7%）、酒精性肝病（9.2%），还有18.9%原因不明。
在239例HCC患者中，148例（61.9%）AFP水平升高，其中26%、15%和13%患者的AFP水平分别超过100、400和1000 ng/ml。19.6%的非HCC肝移植患者AFP升高，但仅3%的AFP水平超过100 ng/ml。199例（83.4%）、164例（68.6%）和197例（82.4%）患者分别接受了超声、CT和MRI检查，其中分别有115例（57.8%）、113例（68.9%）和153例（77.7%）术前检出HCC。 在单个肝癌病灶≤2 cm的HCC患者中，38.1%的AFP水平升高。经超声、CT和MRI检查，分别有34.9%（23/66例）、59.1%（26/44例）和63.1%（41/65例）患者检出HCC。当单个肝癌病灶>2 cm时，分别有69.2%（92/133例）、72.5%（87/120例）和84.8%（112/132例）患者检出HCC。
随着技术发展，MRI的HCC检出率从2000年以前的70.2%（59/84例）升至2000年以后的83.2%（94/113例），对于≤2 cm病灶检出率从40.0%升至73.3%。
研究表明，对HCC的检查，影像学检查较AFP检测敏感有效。对肝脏小病灶的检测，MRI较超声和CT检查均敏感。
我国肝细胞癌的发病率高。既往AFP和超声检查是筛查和发现早期肝细胞癌的重要检测方法。但本文研究结果显示，MRI对于检出肝细胞癌最敏感，最能反映肝细胞癌的病灶体积。但AFP检测简便、价廉，尽管其不够敏感，但水平升高仍有一定价值。
其他辅助检查
1、最常用的是肝脏超声检查，超声检查为非侵入性检查，对人体组织无任何不良影响，其操作简单、直观准确、费用低廉、方便无创、广泛普及，可用于肝癌的普查和治疗后随访。
2、CT已经成为肝癌诊断的重要常规手段。腹部CT增强扫描可清楚地显示肝癌的大小、数目、形态、部位、边界、肿瘤血供丰富程度，以及与肝内管道的关系，对于进一步明确诊断，与其他良性肝脏占位相鉴别，同时明确肝癌的分期分级，对于指导治疗及判断预后有重要意义。通过影像分析软件还可以对肝脏内各管道进行重建，可以精确到各肝段血管的走行，肿瘤与血管的关系，模拟手术切除平面，测算预切除肿瘤的体积和剩余肝体积，极大的提高手术安全性。
3、PET（正电子发射计算机断层扫描）-CT全身扫描可以了解整体状况和评估肿瘤转移情况，更能全面判断肿瘤分期及预后，但是价格较为昂贵，一般不作为首选检查。