病因治疗
这是防治脂肪肝的关键。如病毒性肝炎患者应予以抗病毒、调整免疫、改善肝脏病理和恢复肝功能等的药物治疗，以促使脂肪代谢恢复正常，常用药物如双虎清肝颗粒等。糖尿病患者应从控制血糖，恢复胰腺功能等方面治疗。酗酒及酒精性脂肪肝首先要戒酒。长期使用激素类药及抗痨药，应选择对脂质代谢影响小、肝毒性小的药物，同时配合保肝治疗。营养过剩及肥胖者，则要减少饮食的热量摄入，营养不良者应补充蛋白质、维生素，并消除导致营养不良的各种因素。
控制饮食，降低体重
这是防治脂肪肝的一个中间环节。限制脂肪，尤其是动物脂肪，每天应少于30克;糖类食物也应控制，因为摄入糖类过多，可促进胰岛素分泌而增加糖转化为脂肪，故脂肪肝患者每日主食应控制在250克左右;蛋白质类食物要充足，每日应进食100克含蛋白质食物，因为蛋白质中含有多种氨基酸，其中半胱氨酸、蛋氨酸等能防止肝内脂肪类物质的贮留。古人曰“医食同宗”、 “药食同源”，某些食物如大豆、玉米、玉米须、黄瓜、大蒜、葱头、蘑菇、生姜、海带、牛奶、鸡蛋、茄子、空心菜、韭菜、茶叶、菊花、山楂等均有一定降脂作用。
在控制饮食的同时要逐渐降低体重，每周降0.5至1.0公斤，下降到正常即可。
适度运动
强调适度要因人而异，因病而异。单纯脂肪肝和肥胖者应增加活动量以促进脂肪的消耗，一般2小时步行12公里才能达到减轻体重的目的，坚持跑步也可促进脂肪的消耗。肝炎合并脂肪肝者要视病情而定，转氨酶明显升高时，应以休息为主，接近正常或正常时可逐渐增加运动量，活动时以自觉周身微微汗出，休息后无疲劳感为宜。有条件者可在医生指导下进行。
行为疗法
修正不良习惯可以促进肥胖性脂肪肝患者减肥和防止体重反跳，根据对一些肥胖患者的调查，大部分有明显的饮食习惯，如问诊时得知起居室常备水果，此为先行因素。其对策是“不吃水果”，“家中和单位不放水果”，纠正目的在于去除先行因素。然后再制定每周计划，其达到程度以点数记于日记本上进行自我评估。纠正达到了既定目标后，应给予鼓励以建立其信心，促进患者长期自觉坚持减肥是成功的关键所在，这就是所谓的行为疗法。
药物治疗
治疗脂肪肝没有特效药物。目前临床上的降脂药对脂肪肝有一定的辅助治疗作用。大体上为三类：一类是胆碱类药物，它是通过促进磷脂合成来加速肝内脂肪的运转，如复方胆碱等;第二类是维生素B族类药物，它是通过补充脂肪代谢所需的维生素来促进脂代谢，保护肝细胞，药如维生素B2、维生素B12、烟酸肌醇酯等;第三类是中药，大多为祛湿、化痰、消食化积、活血化瘀、清热降火之品，如陈皮、半夏、枳实、红曲、郁金、水红花子、苦丁茶、全瓜蒌等。
总之，上述是治疗脂肪肝的5个方面，缺一不可。脂肪肝的治疗固然重要，但是预防脂肪肝的发生更为重要。根据脂肪肝发生的机理，应在药物的使用、疾病的控制、饮食的调节和适度的运动等几个方面防患于未然。