正常情况下，子宫内膜生长在子宫腔内，受雌激素的影响，每月脱落一次，形成月经。如果月经期脱落的子宫内膜碎片，随经血逆流经输卵管进入盆腔，种植在卵巢表面或盆腔其他部位，形成异位囊肿，这种异位的子宫内膜也受性激素的影响，随同月经周期反复脱落出血，如病变发生在卵巢上，每次月经期局部都有出血，使卵巢增大，形成内含陈旧性积血的囊肿，这种陈旧性血呈褐色，黏稠如糊状，似巧克力，故又称“巧克力囊肿”。这种囊肿可以逐渐增大，有时会在经期或经后发生破裂，但很少发生恶变。
临床上，对于巧克力卵巢囊肿的治疗方法有很多种，主要有药物调理、口服汤剂、外敷治疗、手术治疗等。药物治疗主要是针对卵巢囊肿早期，此时囊肿较小，对患者并没有表现出其它明显伤害，药物可以对它产生抑制作用，破坏其生长环境进而慢慢对其进行消除。如果患者服用药物一段时间后，囊肿并没有变小，反而有持续增大的迹象，此时患者应该停止服药去医院做进一步的检查为好。
巧克力卵巢囊肿怎么治疗？此病的治疗原则是，对有生育要求的年轻妇女一般采用保守治疗。若症状较重，经保守治疗效果不明显，或卵巢有较大包块的，可以采用保守性手术，如卵巢内膜囊肿巧克力液抽吸术、内膜囊肿剥除术或患侧卵巢切除术，以保留正常卵巢和生育功能。不过，经保守性手术后仍有可能复发。对40岁以上，年龄较大且无生育要求的妇女，可以切除全子宫以及一侧或双侧卵巢和输卵管。
在治疗卵巢巧克力囊肿的同时，为了患者能够早日康复，情谨遵以下几项：
1、增强机体的免疫力，平时注意自身保暖，避免感冒受寒。
2、忌烟，酒，忌葱，蒜，椒，桂皮等刺激性食物，忌肥腻,油煎，霉变，腌制食物。
3、饮食宜清淡，应多食瘦肉、羊血、螺狮、淡菜、乌贼、荠菜、鸡肉、蛋类、鱼类、水果类食品及大量的蔬菜等。
4、保持乐观开朗的心情和平和的心态，避免高度紧张及精神刺激。
5、月经期间杜绝性生活，避免一切剧烈体育运动及重体力劳动。科学的生活规律劳逸结合。
