继发性肝癌系由其他脏器的癌瘤转移而来，又称转移性肝癌。在西方发达国家，继发性肝癌是最多见的肝癌，主要来源于大肠、乳腺和肺的原发癌。
转移性肝癌主要采用药物治疗，即化疗+分子靶向药物（参照原发癌的化疗方案），但对于病情特殊的患者来说，外科手术也是可行的治疗方法。继发性肝癌通常不宜用放射性治疗，原因是高剂量放射很容易造成肝脏损害。但放疗可用来减轻末期患者的疼痛和不适。
转移性肝癌主要表现为肝内多发结节，多不能手术切除。但也有部分患者，特别是原发于结直肠的转移性肝癌可经肝切除而治愈；若不行手术治疗，这类患者的平均生存时间则只有10个月。因此，手术切除是治疗转移性肝癌的最有效方法。此外，还可选择肝动脉结扎术、肝动脉或门静脉栓塞、皮下埋置化疗泵、冷冻、局部注射无水酒精等疗法，从而达到消除或抑制肝转移灶、延长生存时间的目的。
（1）肝动脉化学栓塞（TACE）
转移性肝癌因此滋养血管少，对该种治疗不敏感。可根据造影情况选择应用。
（2）经皮酒精、醋酸或盐酸、硫酸、热盐水或蒸馏水注射治疗
采用无水酒精等瘤内注射治疗转移性肝癌。可取得一定的疗效，并发症少。该类方法具有操作简便、适应证广、副作用少、疗效较好、经济负担少、患者易于接受等特点。
（3）热化疗药物注射治疗
热和化疗药联合应用可改善常规化疗的效果。用于局部消融治疗时，温度一般不超过45°。适用于大的肝转移癌的治疗。
（4）局部注射化疗缓释剂治疗
本法适用于肿瘤数目少于3个，直径<7cm的肿瘤。
（5）经皮冷冻消融治疗
经皮穿刺冷冻治疗肝癌是近年来渐被证实有效的方法之一。对肝内肿瘤少于5个的治疗效果较好。经皮穿刺是在B超、CT或MRI等引导下，准确地将冷冻探针插入到瘤体内。目前多采用氩氦刀或液氮冷冻系统治疗，一般冻融两个循环，可使癌细胞彻底死亡。
冷消融是一种相对安全的治疗方法，并发症较少，疗效较好，深受患者欢迎。
（6）经皮射频消融治疗（PRFA）
PRFA是在超声或CT引导下，准确将带有套管鞘的针型电极插人到肿瘤内，利用射频产生的高温，引起癌细胞凝固性坏死。射频消融治疗对转移性肝癌有一定的疗效。
（7）经皮微波凝固治疗（PMC）、间质激光光凝治疗（ILP）、海扶刀这几种方法主要适应于转移性肝癌的治疗，为一些不能手术切除的肝癌患者提供了根治的可能性。
（8）化疗
全身化疗以原发癌的治疗方案为主，有的方案结合分子耙向药物效果更好，还可将缓释化疗药经皮穿刺植入。化疗药物还可经超声电导仪经皮超声导入，使得肿瘤局部达到较高的血药浓度，所用药物为5-FU及其衍生物、多柔比星和表多柔比星、顺铂和卡铂等。
（9）生物免疫治疗
可应用的药物有IL-2、胸腺肽及干扰素等，以提高机体免疫力。