手术切除是治疗原发性肝癌的主要方法之一，见效快，疗效可靠，只要患者与患者体质允许，都要尽可能地进行手术切除。但是肝癌早期症状不显著，诊断比较困难，多数患者待症状明显发现时，多已不能采取外科根治手术。大多数只能进行二期切除，所以为了提高原发性肝癌的疗效，必须采用综合治疗。
1、与化疗联合治疗
手术可以切除病灶，化疗可以杀灭癌细胞，两者的联合应用，可以起到单一疗法不能起到的作用与疗效。对于需要根治性切除的原发性肝癌，如包膜不完整或缺乏、血管癌栓、子灶等可以予以术前经动脉介入化疗或全身化疗。但对其价值仍有很大争议，认为化疗能损伤肝功能，不利手术及有诱发转移之虑。
在手术过程中，估计有碎片癌组织脱落于胸腹腔内者，可以适当使用化疗药进行清洗，以杀灭脱落的癌细胞。
对于肝癌，在理论上，可以通过手术完全切除，但事实上并非如此，尤其是Ⅱ期肝癌，很难完全手术切除，而且手术过程中可出现癌细胞脱落。因此，术后配合经血管介入化疗，尤其是肝癌主灶切除而尚残留有卫星灶，或有肝内播散灶及肝癌切缘仍有癌肿，肝癌与血管等粘连而估计尚有残留者，必须配合化疗。第二军医大学东方肝胆外科的研究表明，术后TACE具有显著延长术后无瘤生存的作用。但必须指出，肝癌术后系统性化疗的价值尚不明确，对肝功能良好、能耐受化疗者口服卡莫氟等制剂，显示有一定抗复发作用。
2、与放疗的联合
凡估计不能切除的原发性肝癌，可先予放疗，使之缩小至能切除的情况，再予切除。其疗效常与能即期切除者的效果相似。
凡术中或术后发现有下述情况，可在术后进行放疗：①肝癌主灶切除，但尚残留有卫星灶，或有肝内播散灶，术中能作标记，术后予放射治疗。②肝癌切缘仍有癌肿。③肝癌与血管等粘连，估计尚有残留者。④在切除区附近门脉内有癌栓者。术后放射以在术后1个月内为妥。对于术中发现肝癌较大，未能切除，作肝动脉结扎者，可在结扎术后1个月内作放疗，其预后较单纯结扎者为好。
3、与中医药的联合
手术与中医药联合治疗是贯彻局部与整体并重的原则。一般说来，对于肝癌中医药可以参与全过程的治疗。
原发性肝癌的手术范围一般比较广泛，损伤较大。因此，术前进行有效的中医辨证治疗，可明显提高手术完成率及成功率，减少手术并发症及后遗症，缩短手术恢复时间，对手术的预后会有较大的帮助。