普通肝病指标和自免肝指标在肝功能指标、自身抗体、免疫球蛋白、血清铁及铁蛋白、凝血功能等方面存在差异。
1. 肝功能指标：普通肝病常见的肝功能指标异常主要表现为谷丙转氨酶、谷草转氨酶升高，这往往提示肝细胞受到损伤。在一些病毒性肝炎、药物性肝损伤等普通肝病中较为常见。而自免肝除了谷丙转氨酶、谷草转氨酶升高外，碱性磷酸酶和γ-谷氨酰转肽酶也可能出现明显升高，且升高程度可能与病情的活动度相关。
2. 自身抗体：普通肝病一般自身抗体检测多为阴性。但自免肝患者体内会出现多种自身抗体，如抗核抗体、抗平滑肌抗体、抗肝肾微粒体抗体等。这些自身抗体的出现是自免肝的重要特征之一，不同类型的自免肝其自身抗体的阳性组合也有所不同，对于自免肝的诊断和分型具有重要意义。
3. 免疫球蛋白：普通肝病患者免疫球蛋白水平可能正常或仅有轻度升高。自免肝患者常伴有免疫球蛋白G或免疫球蛋白M的显著升高，这是由于自身免疫反应导致免疫系统活跃，产生过多的免疫球蛋白。
4. 血清铁及铁蛋白：部分普通肝病患者血清铁及铁蛋白可能正常，而在一些特殊类型的普通肝病如血色病时会升高。自免肝患者血清铁及铁蛋白也可能出现异常升高，但升高机制与普通肝病有所不同，可能与自身免疫反应影响铁代谢有关。
5. 凝血功能：普通肝病在病情较轻时凝血功能可能正常，随着病情进展到肝硬化等阶段，会出现凝血因子合成减少，导致凝血功能异常。自免肝患者由于肝脏的自身免疫损伤，也会影响凝血因子的合成，且在疾病活动期凝血功能异常可能更为明显。
普通肝病指标和自免肝指标在多个方面存在差异。这些差异有助于医生对疾病进行准确的诊断和鉴别诊断。当发现指标异常时，应及时到正规医院的肝病科就诊，结合患者的症状、病史等进行综合判断，制定合理的治疗方案。遵医嘱进行进一步的检查和治疗，以控制病情发展，提高患者的生活质量。