大姨妈总不干净的原因有内分泌失调、子宫肌瘤、子宫内膜炎、子宫内膜息肉、全身性疾病等。
1. 内分泌失调：女性体内激素水平失衡，如雌激素、孕激素分泌异常，会影响子宫内膜的正常生长和脱落，导致经期延长、月经淋漓不尽。常见于生活不规律、长期精神压力大、过度节食等情况。例如长期熬夜可能打乱生物钟，影响下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的功能，进而引起内分泌失调。
2. 子宫肌瘤：这是女性生殖器官中常见的良性肿瘤。肌瘤可能会使子宫腔增大，子宫内膜面积增加，影响子宫收缩，从而导致月经周期缩短、经期延长、经量增多等症状。黏膜下肌瘤对月经的影响通常更为明显。
3. 子宫内膜炎：细菌感染子宫内膜引发炎症，炎症刺激会使子宫内膜充血、水肿，影响其正常的修复和脱落过程，导致月经持续时间延长，还可能伴有腹痛、白带异常等症状。不注意经期卫生、宫腔手术操作后感染等都可能诱发子宫内膜炎。
4. 子宫内膜息肉：是子宫局部内膜过度生长所致，由子宫内膜腺体、间质和血管组成。息肉会影响子宫的正常收缩和内膜的修复，导致经期延长、经间期出血等。其发生可能与内分泌紊乱、炎症刺激等因素有关。
5. 全身性疾病：如血小板减少性紫癜、再生障碍性贫血等血液系统疾病，会影响凝血功能，导致经期出血不易止住，出现月经总不干净的情况。另外，甲状腺功能异常也可能影响月经周期和经期，甲状腺功能减退时可能出现月经过多、经期延长。
针对这些情况，内分泌失调可通过调整生活方式、缓解压力来改善，必要时可遵医嘱使用戊酸雌二醇、黄体酮、炔雌醇环丙孕酮等药物调节激素水平；子宫肌瘤较小且无症状时可定期复查，较大或症状明显时可能需要手术治疗；子宫内膜炎需遵医嘱使用抗生素治疗，如头孢曲松钠、甲硝唑、阿奇霉素等；子宫内膜息肉可通过宫腔镜手术切除；全身性疾病则需要针对具体疾病进行相应的治疗。
大姨妈总不干净可能由多种原因引起，当出现这种情况时，应及时到正规医院就诊，进行相关检查，如妇科超声、性激素六项、血常规等，以明确病因，并在医生的指导下进行针对性治疗。