小孩吃头孢3天和5天的疗效差别受感染类型、感染程度、个体差异、药物种类、依从性等因素影响。
1. 感染类型：不同类型的感染，头孢发挥疗效的时间不同。比如上呼吸道感染，多由病毒合并细菌引起，症状相对较轻，若对头孢敏感，使用3天可能就可有效控制症状，减轻炎症。但如果是泌尿系统感染，细菌在泌尿系统内较难清除，可能需要5天甚至更长时间的治疗，3天的疗程可能无法完全杀灭细菌，容易导致感染反复。
2. 感染程度：轻度感染时，小孩体内细菌数量较少，炎症反应不严重，头孢使用3天可能就足以抑制细菌生长，使症状缓解并逐渐康复。然而，重度感染时，细菌大量繁殖，炎症范围广且程度深，3天时间可能只是初步控制病情，未能彻底清除细菌，需要5天或更久的治疗才能达到较好的疗效，防止病情反复。
3. 个体差异：每个小孩的身体状况不同，免疫系统功能也有差异。免疫系统较强的小孩，在使用头孢后，身体能够更好地配合药物发挥作用，可能3天就能看到明显的疗效。而免疫系统较弱的小孩，身体对抗细菌的能力较差，药物起效相对较慢，可能需要5天甚至更长时间才能达到与免疫系统强的小孩3天治疗相当的效果。
4. 药物种类：头孢类药物有很多种，如头孢克洛、头孢克肟、头孢丙烯等。不同的头孢药物抗菌谱和药效持续时间有所不同。有些头孢药物抗菌作用强、起效快，使用3天可能就有显著疗效；而有些药物可能需要更长时间才能充分发挥作用，5天的疗程可能效果更好。
5. 依从性：小孩用药的依从性也会影响疗效。如果在用药过程中，小孩不能按时按量服用头孢，3天的治疗可能无法保证药物在体内维持有效的血药浓度，从而影响疗效。而5天的疗程中，即使中间有偶尔的漏服情况，整体上也更有可能达到较好的治疗效果。但如果能保证良好的依从性，3天治疗也可能取得不错的疗效。
小孩吃头孢3天和5天的疗效差别受多种因素综合影响。不能简单地判断哪种疗程更好，需要综合考虑感染类型、程度、个体差异、药物种类以及用药依从性等。在给小孩使用头孢时，应遵医嘱，根据具体病情确定合适的疗程，以确保治疗效果，避免细菌耐药等问题的发生。