宝宝发烧39度时，物理降温和药物降温各有优劣，需综合考虑发烧原因、降温速度、持续时间、适用人群、安全性等因素来选择合适的降温方式。

1. 发烧原因：宝宝发烧39度可能由多种原因引起，如病毒感染、细菌感染等。若是轻微感染且宝宝精神状态尚可，物理降温可作为首选尝试；若因严重感染导致发烧，可能需及时使用药物降温，并配合对因治疗。

2. 降温速度：药物降温速度相对较快。像布洛芬、对乙酰氨基酚、阿司匹林等药物，服用后通常能在较短时间内使体温下降。而物理降温起效相对较慢，如用湿毛巾敷额头、温水擦浴等方式，需持续一段时间才可能看到体温有明显变化。

3. 持续时间：药物降温效果持续时间相对较长，合理使用退烧药能在数小时内维持体温稳定。物理降温效果持续时间较短，一旦停止物理降温措施，体温可能会再次升高。

4. 适用人群：部分宝宝可能对药物有不良反应，如胃肠道不适等，这类宝宝可能更适合物理降温。而对于一些体温持续39度且精神萎靡的宝宝，应及时使用药物降温，避免高热惊厥等并发症。

5. 安全性：物理降温安全性较高，一般不会有明显副作用，但操作不当也可能让宝宝着凉。药物降温若使用不当，可能会有不良反应，如损伤肝肾功能等，所以使用药物降温时必须遵医嘱。

宝宝发烧39度时，物理降温和药物降温没有绝对的好坏之分。要根据具体情况灵活选择，可先尝试物理降温，若效果不佳或宝宝状态不好，应及时使用药物降温，并尽快就医明确发烧原因，进行针对性治疗。无论选择哪种方式，都要密切关注宝宝体温变化和精神状态。

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