大排畸和小排畸在检查时间、检查目的、检查项目、检查手段、检查要求等方面存在不同。
1. 检查时间：大排畸通常在孕20 - 24周左右进行，这个时期胎儿的各个器官已经基本发育成型，羊水量适中，胎儿在子宫内的活动空间较大，便于医生清晰地观察胎儿的结构。小排畸一般在孕28 - 32周进行，此时胎儿进一步发育，之前一些在大排畸时可能不明显的问题，在这个阶段可能会更清晰地显现出来。
2. 检查目的：大排畸主要是对胎儿进行全面、系统的检查，排查胎儿是否存在重大的结构畸形，如无脑儿、脊柱裂、先天性心脏病、唇腭裂等。小排畸则侧重于监测胎儿的生长发育情况，观察胎儿的大小、胎位、羊水情况等，同时也会再次检查胎儿的一些器官，查看是否有新出现的异常情况。
3. 检查项目：大排畸检查项目较为详细和全面，会对胎儿的头部、面部、颈部、胸部、腹部、四肢等各个部位进行逐一检查，评估器官的形态、大小、结构是否正常。小排畸检查项目相对简化，重点关注胎儿的生长指标、胎盘和羊水情况，以及之前大排畸检查中发现的可疑部位是否有变化。
4. 检查手段：两者主要的检查手段都是超声检查，但大排畸通常采用的是系统超声检查，需要医生有较高的专业技能和丰富的经验，检查时间相对较长，以确保能够全面、细致地观察胎儿。小排畸一般是常规超声检查，检查过程相对简单、快捷。
5. 检查要求：大排畸检查前一般不需要空腹或憋尿，孕妇可以正常饮食，但可能需要提前预约，并且在检查时需要胎儿配合，如果胎儿的体位不好，可能会影响检查结果，需要孕妇适当活动后再次检查。小排畸检查同样不需要特殊准备，不过如果检查时胎儿不配合，也可能需要孕妇走动或吃点东西来刺激胎儿活动，以便获得更准确的检查结果。
大排畸和小排畸都是孕期重要的检查项目，它们在不同的孕周发挥着不同的作用，共同保障胎儿的健康发育。孕妇应按照医生的建议，按时进行这两项检查，以便及时发现问题并采取相应的措施。