长期鼻痛时，鼻咽镜不能完全准确排除鼻咽癌，受病变部位、病变早期特征、检查者经验、设备因素、其他疾病干扰等影响。
1. 病变部位：鼻咽癌的病灶位置多样，有些病灶可能隐藏在鼻咽部的隐蔽角落，如咽隐窝深部、鼻咽顶壁的微小凹陷处等。这些位置即使使用鼻咽镜检查，也可能因角度或视野受限而难以被发现，导致漏诊。
2. 病变早期特征：在鼻咽癌早期，肿瘤可能仅表现为黏膜的轻微增厚、色泽改变或微小隆起，这些细微的变化在鼻咽镜下可能不具有典型的恶性特征，与一些良性病变如炎症等难以区分，容易被误诊为良性病变，从而无法准确排除鼻咽癌。
3. 检查者经验：鼻咽镜检查的准确性在很大程度上依赖于检查者的专业经验和技能。经验丰富的医生能够更敏锐地察觉鼻咽部的细微异常，准确判断病变的性质。而经验不足的医生可能会忽略一些重要的线索，导致对病情的误判。
4. 设备因素：不同的鼻咽镜设备在清晰度、分辨率和照明效果等方面存在差异。先进的设备能够提供更清晰的图像，有助于发现微小病变。如果使用的设备性能不佳，可能会影响对病变的观察和判断，降低排除鼻咽癌的准确性。
5. 其他疾病干扰：鼻咽部存在多种疾病，如鼻咽炎、鼻咽部息肉等，这些疾病的症状可能与鼻咽癌相似，在鼻咽镜下也可能有类似的表现。当存在这些疾病时，会干扰对鼻咽癌的诊断，增加准确排除鼻咽癌的难度。
6. 病理结果的局限性：即使在鼻咽镜检查中发现了可疑病变并进行了活检，病理结果也可能存在假阴性。这可能是由于活检取材未取到肿瘤组织，或者肿瘤细胞的异质性导致部分区域的细胞表现不典型，从而影响了病理诊断的准确性。
综上所述，长期鼻痛时，鼻咽镜检查虽然是排查鼻咽癌的重要手段，但由于病变部位、早期特征、检查者经验、设备因素、其他疾病干扰以及病理结果局限性等多种因素的影响，不能完全准确地排除鼻咽癌。如果出现长期鼻痛等可疑症状，除了进行鼻咽镜检查外，还可能需要结合其他检查方法，如影像学检查、血液检查等，以提高诊断的准确性。一旦发现异常，应及时到正规医院的相关科室进一步检查和诊断。