囟门凹陷是否影响宝宝智力发育，受多种因素影响，如脱水、营养不良、颅内疾病、先天性脑发育不全、内分泌疾病等。
1. 脱水：宝宝因腹泻、呕吐、发热等原因导致身体失水过多，出现脱水情况时，囟门会凹陷。若脱水情况较轻且能及时纠正，一般不会对智力发育产生明显影响。但如果脱水严重且持续时间较长，会影响大脑的血液灌注和营养供应，可能对宝宝的智力发育造成一定损害。例如，严重腹泻导致的重度脱水，可能会使宝宝出现精神萎靡、嗜睡等症状，影响大脑正常功能。
2. 营养不良：长期营养摄入不足，尤其是蛋白质、维生素和矿物质缺乏，会导致宝宝身体消瘦、皮下脂肪减少，囟门也会出现凹陷。营养不良会影响宝宝大脑神经细胞的发育和功能，进而影响智力发育。比如，缺乏铁元素会影响血红蛋白的合成，导致大脑缺氧，影响认知能力；缺乏维生素B12会影响神经系统的正常发育。
3. 颅内疾病：如脑膜炎、脑炎等颅内感染性疾病，可能导致颅内压力降低，引起囟门凹陷。这些疾病如果没有得到及时有效的治疗，炎症可能会损伤大脑组织，影响神经功能，对宝宝的智力发育造成严重影响。此外，颅内出血后如果血液吸收不良，也可能导致颅内压力改变，影响大脑发育。
4. 先天性脑发育不全：部分宝宝由于先天性的脑部发育异常，如脑萎缩、脑发育迟缓等，会出现囟门凹陷的情况。这种情况下，宝宝的智力发育往往会受到不同程度的影响，可能表现为智力低下、运动发育迟缓、语言发育障碍等。
5. 内分泌疾病：某些内分泌疾病，如甲状腺功能减退症，会影响宝宝的新陈代谢和生长发育，导致囟门凹陷。甲状腺激素对大脑的发育至关重要，甲状腺功能减退如果没有及时发现和治疗，会影响宝宝的智力发育，出现智力低下、反应迟钝等症状。
6. 其他因素：极少数情况下，宝宝的囟门凹陷可能是由于遗传因素或其他罕见疾病引起的。这些疾病可能会伴随一些特殊的临床表现，对宝宝的整体健康和智力发育产生潜在影响。
综上所述，囟门凹陷是否影响宝宝智力发育不能一概而论，取决于导致囟门凹陷的具体原因。如果是轻微脱水或短暂的营养缺乏等原因引起的，在及时纠正后通常不会对智力发育造成明显影响。但如果是颅内疾病、先天性脑发育不全或内分泌疾病等严重情况导致的，很可能会影响宝宝的智力发育。因此，当发现宝宝囟门凹陷时，应及时带宝宝到正规医院就诊，查明原因，并进行针对性的治疗和干预，以保障宝宝的健康成长。