16个月男宝宝身高体重不达标，可能隐藏的疾病风险有营养不良、消化系统疾病、内分泌疾病、慢性感染性疾病、先天性心脏病等。
1. 营养不良：宝宝生长发育迅速，对营养需求较高。若喂养不当，如辅食添加不合理、奶量摄入不足等，易导致蛋白质、维生素、矿物质等营养素缺乏，影响身高体重增长。例如，缺乏钙会影响骨骼发育，缺乏铁会导致贫血，进而影响身体的正常代谢和生长。治疗上，需调整喂养方式，保证营养均衡，可在医生指导下适当补充维生素D、钙剂、铁剂等药物，如维生素D滴剂、碳酸钙D3颗粒、富马酸亚铁颗粒等，但要遵医嘱。
2. 消化系统疾病：如慢性腹泻、乳糖不耐受、食物过敏等。慢性腹泻会使营养物质吸收不良，导致宝宝体重不增。乳糖不耐受的宝宝无法完全消化乳糖，会出现腹胀、腹泻等症状，影响营养吸收。食物过敏则可能引起胃肠道炎症，影响消化功能。治疗时，对于慢性腹泻，要明确病因，针对性治疗，可使用蒙脱石散、双歧杆菌四联活菌片、复方胃蛋白酶散等药物。乳糖不耐受可选用无乳糖奶粉，食物过敏则需避免接触过敏原。
3. 内分泌疾病：常见的有甲状腺功能减退症。甲状腺激素对宝宝的生长发育起着重要作用，甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，会导致代谢减慢，生长发育迟缓，身高体重增长缓慢。治疗主要是补充甲状腺激素，常用药物有左甲状腺素钠片等，需定期复查甲状腺功能，调整药物剂量。
4. 慢性感染性疾病：如结核病、慢性肾盂肾炎等。这些疾病会消耗宝宝的能量，影响食欲和营养吸收。结核病是由结核杆菌感染引起，除了影响生长发育，还会有低热、盗汗、乏力等症状。慢性肾盂肾炎则会反复出现泌尿系统症状。治疗需根据具体疾病进行抗感染治疗，如使用异烟肼、利福平、吡嗪酰胺等抗结核药物治疗结核病。
5. 先天性心脏病：心脏结构异常会导致心脏功能受损，影响血液循环，使身体各器官得不到充足的血液供应，从而影响生长发育。宝宝可能会出现活动耐力下降、呼吸急促等症状。治疗一般需要根据病情进行手术治疗或介入治疗。
16个月男宝宝身高体重不达标可能是多种疾病的表现。家长应密切关注宝宝的生长发育情况，若发现异常，及时带宝宝到正规医院就诊，进行全面检查，明确病因，并在医生的指导下进行针对性治疗。早期诊断和治疗对于宝宝的健康成长至关重要。