右肾隐隐作痛的原因有很多，常见的有泌尿系统结石、泌尿系统感染、肾囊肿、肾积水、腰肌劳损等。
1. 泌尿系统结石：结石在肾脏内移动或卡在输尿管中，会刺激肾脏组织和输尿管黏膜，引起疼痛。较小的结石可能会随着尿液排出，在排出过程中可能会引起剧烈绞痛；较大的结石可能长期停留，导致肾脏隐痛。治疗方法包括药物排石，如排石颗粒、肾石通颗粒、金钱草颗粒等，遵医嘱使用可促进结石排出；体外冲击波碎石，利用高能冲击波聚焦后击碎结石；手术取石等。
2. 泌尿系统感染：细菌等病原体侵袭泌尿系统，引发肾盂肾炎等感染性疾病。炎症刺激肾脏组织，导致肾脏出现隐痛，还可能伴有尿频、尿急、尿痛、发热等症状。治疗主要是使用抗生素，如阿莫西林、头孢克肟、左氧氟沙星等，遵医嘱用药以控制感染。
3. 肾囊肿：随着囊肿逐渐增大，会对周围组织产生压迫，引起肾脏隐痛。较小的肾囊肿一般不需要特殊处理，定期复查即可；较大的囊肿（直径大于 5cm）或引起症状的囊肿，可能需要手术治疗，如囊肿去顶减压术。
4. 肾积水：尿液排出受阻，在肾脏内积聚，导致肾盂肾盏扩张，引起肾积水。肾积水会使肾脏内压力升高，从而产生隐痛。治疗需要明确病因，如结石、肿瘤、狭窄等，针对病因进行治疗，如解除梗阻、手术切除肿瘤等。
5. 腰肌劳损：长期保持不良姿势、过度劳累等，可能导致右侧腰部肌肉劳损。腰肌劳损引起的疼痛可能会被误认为是肾痛，疼痛通常在劳累后加重，休息后缓解。治疗可采用物理治疗，如热敷、按摩、针灸等，也可遵医嘱使用非甾体抗炎药，如布洛芬、双氯芬酸钠、萘普生等缓解疼痛。
右肾隐隐作痛可能由多种原因引起，不同原因的治疗方法也有所不同。如果出现右肾隐痛的症状，应及时到正规医院就诊，进行相关检查，如尿常规、肾功能、超声、CT 等，以明确病因，并在医生的指导下进行针对性治疗。