飞机耳朵疼可能是气压变化、咽鼓管功能不良、耳部炎症、航空性中耳炎、鼓膜穿孔等因素导致，多数情况下是小问题，但也可能存在大隐患。
1. 气压变化：飞机在起飞和降落过程中，外界气压会快速变化。而中耳内的气压不能及时与外界气压平衡，就会导致中耳内外压力差增大，引起耳朵疼痛。这种情况较为常见，通常在飞机平稳飞行或气压恢复正常后，症状会逐渐缓解，一般属于小问题。
2. 咽鼓管功能不良：咽鼓管是连接中耳和鼻咽部的通道，其主要作用是调节中耳内的气压。当咽鼓管功能不良时，如咽鼓管堵塞、狭窄等，中耳内的气压无法随外界气压变化而及时调整，就容易在坐飞机时出现耳朵疼的症状。部分患者通过吞咽、咀嚼等动作可使咽鼓管开放，缓解疼痛，但如果咽鼓管长期功能不良，可能会引发其他耳部问题。
3. 耳部炎症：本身患有外耳道炎、中耳炎等耳部炎症的人，坐飞机时气压变化可能会加重炎症反应，导致耳朵疼痛加剧。这类情况若不及时治疗，炎症可能会进一步扩散，影响听力，属于需要关注的问题。
4. 航空性中耳炎：是坐飞机时常见的耳部疾病，由于气压变化导致中耳内形成负压，引起中耳黏膜充血、渗出等炎症反应。患者除了耳朵疼，还可能出现耳鸣、听力下降等症状。轻度的航空性中耳炎经过适当休息和治疗可以恢复，但严重的可能会导致中耳积液、粘连等并发症，对听力造成不可逆的损害。
5. 鼓膜穿孔：较为少见，但如果坐飞机前耳部曾受到外伤导致鼓膜穿孔，气压变化可能会刺激穿孔部位，引起剧烈疼痛，还可能导致中耳感染，严重影响听力，这属于相对严重的情况。
飞机耳朵疼多数时候是气压变化引起的短暂不适，属于小问题，通过一些简单方法可缓解。但如果是由耳部疾病或气压变化引发严重并发症导致的疼痛，则可能是大隐患，需要及时就医治疗。若坐飞机后耳朵疼痛持续不缓解或伴有其他不适症状，应尽快前往正规医院的耳鼻咽喉科就诊。