丙肝病毒根乙肝病毒一样可在患者肝脏内大量繁殖，导致肝脏的慢性损害，久而久之，这种肝脏的慢性破坏可导致瘢肝脏的纤维化”，再进一步则可发展为肝硬化甚至原发性肝癌。
药物联合，提高疗效
丙肝抗病毒治疗的发展经过了三个重要阶段。
在α干扰素应用到临床之前，我们没有特殊的治疗方法，α干扰素的治疗揭开了丙肝抗病毒治疗的新篇章，这是第一个里程碑；此后发现α干扰素联合利巴韦林（过去称“病毒唑”）可以显着提高抗病毒的效果，因此，利巴韦林作为联合治疗用药成为丙肝抗病毒治疗的第二个里程碑；2003年在我国上市的聚乙二醇化干扰素联合利巴韦林的治疗方案，达到了目前丙肝抗病毒治疗的最高疗效，是丙肝抗病毒治疗的第三个里程碑。
如果正确治疗，可以使3/4的丙肝患者获得持续的抗病毒应答。不过，目前仍有部分丙肝患者不重视抗病毒治疗，只是进行一般的保肝降酶对症治疗。在了解了治疗新进展后，患者应增强战胜疾病的信心，重视正规的抗病毒治疗，争取痊愈的机会，防止发展为肝硬化和肝癌。
治疗目标，抑制病毒复制
抗丙肝病毒治疗的目标当然是希望能够彻底清除人体内的丙肝病毒，但在目前条件下还难以做到这一点。因此，只有退而求其次，最大限度地抑制或压制病毒的繁殖，也就是使血液中的病毒转阴（实际上是降低到检测不到的水平）。这样也能延缓或减轻肝脏的破坏，从而尽量避免发展为肝硬化、肝衰竭或肝癌，同时也能改善生活质量。
抗病毒治疗，并非人人适用
不是所有的丙肝患者都需要抗病毒治疗。
首先，一定要经过化验证明血液中的丙肝病毒核糖核酸（HCV RNA）阳性时才需要抗病毒治疗。有些人单纯丙肝病毒抗体（抗-HCV）阳性，但是HCV RNA阴性，这种情况一般认为是既往发生的丙肝病毒的感染，或处于病情的恢复期，或病程的稳定状态，不需要抗病毒治疗。
目前对于慢性乙肝患者的抗病毒治疗，不仅要求其乙肝病毒脱氧核糖核酸（HBV DNA）阳性，而且要求其转氨酶升高2倍以上，这是因为转氨酶正常的情况下，抗病毒治疗效果很差。
但最近的研究发现：转氨酶正常的丙肝患者对于抗病毒的疗效与转氨酶升高者相似，所以对血液中HCV RNA阳性的患者，即使其转氨酶无明显升高，也可给予抗病毒治疗。
