对于IC的治疗模式是根据目前针对疾病病因的一个或两个优势理论直接制定的。我们对这一临床难题制定了一个全面，系统，可操作的临床治疗方案。
A：口服药物治疗
1、戊聚糖多硫酸钠
此药是唯一一个由FDA批准的用于治疗IC的药物。其作用机制是纠正膀胱上皮的糖胺聚糖缺失。不同的文献报道有30-40%的患者报告其症状有40-50%的改善。由于其可能需要6个月或一年才能起效，因此建议给与长期口服药物治疗。
2、抗组胺药物
抗组胺药物药效的多变性可通过前文所述的病理生理学模式：即肥大细胞脱颗粒只是导致炎症反应和相关事件的事件链中的一步。羟嗪应在睡前从10mg开始给与，直至到75mg。要大约1-3月症状才有可能缓解。
3、抗抑郁药
抗抑郁药（TCA，SSRIs）治疗IC的作用大部分源于其作为一种疼痛神经调节剂的作用机制。本类药物剂量应逐渐升高，以尽可能避免其副作用。可在疾病的起始阶段应用此药，特别是当疼痛是主要症状表现时。阿米替林（Elavil）一般在睡前从10mg或20mg开始给起，若能耐受直至75mg。盐酸氟西汀（Prozac）起始剂量为20mg/d，若有必要可加至40mg。舍曲林（Zoloft）是可使用的另一种抗抑郁药，并且耐受性较好，起始剂量可以是50mg/d，直至加到100mg/d。 抗抑郁药的作用机制是多方面的：其能够促进睡眠，减少夜尿；通过提高疼痛阈值从而起到神经调节作用；改善情绪；对膀胱有抗胆碱能作用从而减少由逼尿肌不稳定导致的尿频。
4、抗胆碱能药物和抗痉挛药
患者有轻度症状或同时存在膀胱不稳定能通过这类药物缓解疼痛，但是对于中到重度症状，效果较差。“
B：膀胱内治疗
1、二甲基亚砜（DMSO）
DMSO是一种有机溶剂，具有抗炎，止痛和肌肉松弛作用。同时还具有胶原溶解效应，长期应用DMSO能增加组织纤维化的可能性，有可能在几个疗程的治疗后，潜在性的引起特异性、进展性抵抗。对已发表的针对300多名患者的经验回顾分析发现：在其发病率较小的情况下相当一部分病人反应良好（32）。此药仍旧是主要的治疗药物，同氢化可的松，肝素和碳酸氢钠同时使用能增加其效果。
2、肝素
文献报道膀胱内缓慢灌注肝素能够治疗IC。每天用量可以将肝素10，000-20，000单位溶于10毫升盐水中。症状缓解期限从2-6月不等，经过1-2年治疗后效果最好。作用机制同戊聚糖多硫酸钠相似，肝素还能够恢复上皮的渗漏性。
3、西施泰
文献报道西施泰膀胱灌注可以有效修复膀胱粘膜屏障层，减少膀胱内有害物质对膀胱间质层的侵犯，减少尿频，憋尿痛等膀胱刺激症状，膀胱灌注6-8次后逐渐见到效果，对于IC患者，缓解膀胱不适的总有效率较高，约为70-80%。同时对于反复性泌尿道感染的患者，长期的膀胱灌注，能够缓解反复泌尿道感染的复发几率，尤其对于绝经后反复泌尿道感染的老年女性有效。
C：肌肉锻炼
针对盆底肌肉的物理疗法对IC患者有治疗作用。这一理论的基础是：盆底功能障碍作为起始事件，会导致膀胱壁神经性炎症和盆底肌肉张力增高，两者都有可能是疼痛的原因，10名IC患者接受了肌筋膜物理治疗，即经阴道用一个手指对尿道周围组织进行挤按和侧方的牵拉及向耻骨联合方向挤压耻骨尿道肌肉，随后经阴道进行向后方的牵拉，和作耻骨阴道肌肉的等容收缩。
10人中有7人报告其症状在平均随访19个月后，有中度到明显（51-99%）的缓解。患有尿急-尿频综合症（该症状被认为是IC的轻度症状）伴或不伴疼痛的患者也对此治疗有反应，大约有83%的患者报告症状有中度至明显的改善或症状完全缓解。经阴道的Theile按摩法对IC患者也有治疗效果，有大约90%的患者症状有短时间的缓解 。
骶神经调节（膀胱起搏器）
利用膀胱起搏器进行骶神经刺激近来被用来治疗IC患者，效果令人振奋。近来一项多中心的研究发现有60%-80%的患者其IC症状中的尿频和疼痛症状明显缓解 。
其他作者也报道了相似的报告 ，可以在那些有难治性IC症状或口服、盆内治疗效果不好的患者考虑行骶神经刺激。骶神经刺激的作用机制尚不明了，但有可能因为IC是一种神经源性介导的膀胱炎。有意思的是上文提到的IC的两个尿中的标志物：肝素结合表皮生长因子（HB-EGF）和抗增值因子（APF），随着骶神经刺激缓解IC 症状后，也恢复了正常水平。“同时骶神经调节对于顽固性间质性膀胱炎引起的继发性盆底肌肉痉挛导致的盆腔疼痛也有很好的治疗效果。
D：外科治疗
1、膀胱镜和水扩张
如前文所述，膀胱镜和水扩张会对一些患者有治疗效果，可使60%的患者的症状在4-12个月内有所缓解。虽然有证据证实水扩张导致肌肉拉伸后2周后，尿中HB-EGF水平升高，APF的水平降低，但这一方法的机制尚不清楚。
2、膀胱扩大，膀胱全切和尿流改道
膀胱扩大，膀胱全切尿流改道仍是那些症状顽固，对侵袭性较小的方法无明显效果患者的最后治疗办法。绝大多数患者在进行单纯膀胱切除或三角区上膀胱切除术加肠膀胱成形术后症状都会缓解，但是也有极少数患者报道仍存在顽固的盆底疼痛。
