新疆制药厂是由原位于乌鲁木齐市鲤鱼山路8号新疆制药厂和位于乌鲁木齐市宝山路1号新疆中药总厂通过优化整合组建的，集中药、民族药、化学药生产为一体的综合性制药企业。坐落在新疆乌鲁木齐市头屯河区工业园区沙坪西街21号，占地面积197200m2，建筑面积34315 m2，道路硬化面积32000 m2，绿化面积63200 m2。

　　为加快集团医药工业的发展，做大做强自治区医药产业，新疆药业集团以土地置换、申报国债贴息项目等方式，募集资金1.2亿元，按照国家《药品生产质量管理规范》的要求，于2002年5月开始，对新疆制药厂的厂房设施、生产设备、工艺流程、质检仓储设施、环保洁净工程进行了全面的技术改造。2003年11月，综合制剂厂房、综合办公楼、锅炉房、配电供水系统、仓储设施等已竣工交付使用，综合提取车间、中药材库房即将建成投入使用。2004年1月26日通过了国家食品药品监督管理局GMP认证。