一、抗病毒治疗无关紧要
由于许多乙肝病毒携带者终生不发病，这使得一些应该接受治疗的慢性乙型肝炎患者误认为抗病毒治疗无关紧要，肝功能异常时服用一些降酶药物就行了。这些患者长期不愿就医，也不愿配合医生的系统治疗，甚至放弃定期的肝功能和病毒学指标的监测，一旦病情严重而不得不就医时，往往已经发展为重型肝炎或肝硬化期。
的确，有些乙肝病毒携带者可终生不发病。但乙肝病毒对人体的损害常常是在体内静悄悄地进行，多数慢性肝炎患者在转氨酶轻度升高时并无明显症状。因此，我们常说乙肝病毒是体内潜伏的“特务”，乙肝病毒感染者应该随时保持警惕，定期到医院检查肝功能和乙肝病毒学指标，一旦发现异常，应立即就医，根据医生的治疗方案进行抗病毒治疗。
二、盲目相信一些广告
一些乙肝患者为了治疗疾病，盲目相信一些广告。有一位肝功能正常的乙肝“小三阳”患者，盲目听信广告，花了近两万元钱，不但没有使乙肝病毒清除，还因药物中毒导致了药物性肾损害。还有一些患者看到一则抗乙肝药物在转基因鼠上试验的报道，就认为这种药物一定能治好乙型肝炎。
一种有效的抗病毒药物都要按照国际上统一的GCP标准，经过临床前(动物)、Ⅰ期(健康人和少数病人)、Ⅱ期和Ⅲ期(国际多中心、双盲对照)的临床研究才能正式上市，有些药物还要经过Ⅳ期临床研究。在这些试验中，不仅要观察药物的有效性，还要观察其安全性。这一过程，至少要经过2～3年。在这些试验结束前，谁也不能断定其在临床上肯定有效和安全。
三、没有适应症随便用药
乙型肝炎的抗病毒药物属于处方药，其最佳适应症是HBVDNA阳性、ALT反复波动在100～300单位的慢性活动性肝炎病人。另外，一些肝硬化患者，要进行肝、肾移植术的乙肝感染者，肿瘤化疗期和围手术期的乙肝感染者也可使用。但目前常看到一些肝功能正常的患者为了达到清除乙肝病毒的目的而自行购药治疗，尽管在治疗的初期可以达到HBVDNA阴转的结果，但停药后仍会再次升高，结果导致病毒发生耐药，甚至在患者真正需要抗病毒治疗时，无法选择有效的治疗药物。
另外，由于一些新的核苷类抗病毒药物对胎儿的影响尚不完全清楚，在妊娠早期不应使用。干扰素对甲状腺功能有一定的影响，对血象也有抑制作用，有甲状腺疾患和白细胞较低的乙肝患者也应慎用。患者自行购药治疗是十分错误和危险的。
四、治疗期间不进行监测
抗乙肝病毒的药物是否达到了效果，是否产生了耐药，主要依靠治疗期间的监测。如果治疗3个月以上，患者的HBVDNA滴度未见下降，说明这种抗病毒药物治疗无效，就应该更换其他抗病毒药物治疗;如果达到疗效，可继续治疗一段时间后停药;如果用药期间出现HBVDNA和ALT的反跳，可能是因为病毒发生了变异，对药物产生了耐药。
另外，有些抗病毒药物在治疗期间可能会发生一些不良反应，这些不良反应都需要在治疗中定期检查才能及时发现。
五、对抗病毒治疗期望值过高
由于一些乙肝病毒感染者在社会上受到一定的歧视，造成他们迫切追求所谓转阴治疗，并对乙肝的抗病毒药物期望值过高。在抗病毒治疗期间，不去注意肝功能改善和乙肝病毒DNA的抑制，而一味期望乙肝病毒表面抗原阴转。其实，目前的乙肝抗病毒药物仅能起到抑制乙肝病毒复制的作用，并不能把乙肝病毒从体内完全清除。抗病毒治疗的目的是抑制乙肝病毒的复制，改善肝脏功能，缓解肝细胞的病理损害。要坚持持久的治疗，使乙肝病毒长期处于抑制状况，最终达到HBVDNA阴转，肝功能恢复，e抗原阴转，并出现e抗体的病毒“冬眠”状况，使肝细胞得到保护。