月经三个月没来可能由多种因素引起，包括内分泌失调、妇科疾病、精神压力、过度节食和药物影响等。
1. 内分泌失调：内分泌系统在女性月经周期中起着关键作用。当内分泌失调时，激素水平会出现异常。例如，甲状腺功能异常，甲状腺激素分泌过多或过少，会影响下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的功能，进而干扰月经周期。多囊卵巢综合征也是常见的内分泌疾病，患者体内雄激素水平升高，促性腺激素比例失调，导致卵泡不能正常发育和排卵，从而出现月经稀发甚至闭经。
2. 妇科疾病：一些妇科疾病会对月经产生明显影响。子宫内膜炎是子宫内膜的炎症，炎症会破坏子宫内膜的正常结构和功能，影响其周期性的增生和脱落，导致月经紊乱。子宫肌瘤是子宫平滑肌组织增生形成的良性肿瘤，较大的肌瘤可能会压迫子宫内膜，影响子宫的正常收缩和血液循环，引起月经异常。宫腔粘连通常是由于子宫内膜受损后粘连在一起，使月经血流出不畅，严重时会导致闭经。
3. 精神压力：长期处于精神紧张、焦虑、抑郁等不良情绪状态下，会影响神经系统的功能，进而干扰内分泌系统。神经系统与内分泌系统相互调节，精神压力会使下丘脑分泌的促性腺激素释放激素减少，导致垂体分泌的促卵泡生成素和促黄体生成素减少，影响卵巢的排卵功能和激素分泌，最终导致月经推迟或闭经。
4. 过度节食：过度节食会导致身体营养不良，脂肪含量过低。脂肪是合成雌激素的重要原料，当体内脂肪不足时，雌激素的合成会受到影响。雌激素水平下降会影响子宫内膜的生长和发育，使月经周期紊乱。此外，过度节食还可能导致下丘脑功能紊乱，进一步加重月经失调的情况。
5. 药物影响：某些药物会影响月经周期。避孕药中含有激素成分，通过抑制排卵和改变子宫内膜环境来达到避孕的目的，长期或不规律服用可能会导致月经推迟或闭经。抗抑郁药、抗精神病药等药物可能会影响神经系统和内分泌系统的功能，干扰月经周期。
月经三个月没来是一个需要引起重视的问题，其原因较为复杂。内分泌失调、妇科疾病、精神压力、过度节食和药物影响等都可能导致这种情况的发生。如果出现月经异常，应及时调整生活方式，保持良好的心态和合理的饮食。若症状持续不缓解，建议及时到正规医院的妇产科就诊，进行相关检查，如性激素六项、B 超等，以明确病因，并在医生的指导下进行针对性治疗。常用的治疗药物有黄体酮、地屈孕酮、戊酸雌二醇等，但具体用药需遵医嘱。