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科学家成功利用基因组的社交网络寻找驱动癌症发生的基因突变

转载 来源: 生物谷 2017/12/6 11:34:16

任何一个肿瘤都可能有成千上万个不同的基因突变,但对研究者而言,#!大的挑战就是如何寻找到驱动突变,这些突变通常能够促进癌变效应,有望成为潜在疗法的新型靶点。

近日,刊登在国际杂志Nature Methods上的研究报告中,来自麻省总医院等机构的研究人员成功利用一种开源计算机工具,通过将癌症基因组数据同蛋白互作数据相结合,成功找到了驱动癌症的近突变,NetSig工具就是研究者所使用的一种补充工具,其能够从当前的分析数据流中有效扩展对癌症基因组的发现。

蛋白互作能够揭示一类基因组脸谱,这是一种能够通过基因共享信息并且携带特殊功能的社交网络,这种额外的功能视角还能帮助研究人员有效鉴别出一些高度可靠的驱动子,尤其是很少发生突变的基因。为了开发出NetSig工具,研究人员对来自4742份涉及21中癌症类型的肿瘤样本的外显子组数据进行归并整合,随后研究人员在一系列实验中证实了NetSig的能力。

这种新型工具—NetSig具有如下功能:1)能够在所检测的60%的肿瘤类型中识别出已知的的癌症驱动子,包括那些相对较少的样本;2)能够预测证实实验证明具有促肿瘤效应的新型驱动基因;3)能够在TCGA和其它数据库中鉴别出迄今为止未被注意的驱动基因,尤其是,NetSig工具还能够发现,此前被认为致癌基因阴性(也就是说,未在患者机体中检测到致癌基因)的肺部肿瘤患者中有4%至14%的患者或许会携带有促进癌症发生的AKT2或TFDP2基因的额外拷贝。

(责编:叶圻 )

会议合作、活动报道需求可联系彭先生:18820041981(微信同号)。

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相关问答
Q:病毒癌基因与原癌基因的关系和区别是否适合服用参一胶囊

癌基因(proto-oncogene)本身是管理细胞分裂周期的基因,一般都是Cdk家族或者一些信号的受体家族,比如说是EGF(表皮生长因子)。当他们发生突变,或者是转录失去控制,就会使细胞分裂加速,导致癌症。 病毒癌基因,因为病毒需要细胞复制,来提供其所需要的复制条件(细胞器,结构分子),所以,有些病毒携带的基因结构和功能上类似于细胞内对细胞周期进行调控的分子,因为病毒分裂快,所以细胞很快就会在病毒癌基因的刺激下分裂,继而发生突变,失去控制。有些逆转录病毒,将其自身的基因组插入宿主的基因组,因为病毒基因启动子的高效性,当处于原癌基因附近时,就会造成原癌基因过度表达。但是,由于插入位置不确定,所以将宿主细胞转变成癌细胞的可能性很小,也比较慢。这和上一种情况有区别,但是,这种病毒基因,不叫病毒癌基因。 不同的癌症类型需要医生的处方才可以服用参一胶囊,参一胶囊的药理机制是抑制肿瘤血管上皮细胞的生成,对抑制肿瘤复发和转移有显著疗效。

Q:遗传基因检测

通过使用基因芯片分析人类基因组,可找出致病的遗传基因。癌症、糖尿病等,都是遗传基因缺陷引起的疾病。医学和生物学研究人员将能在数秒钟内鉴定出最终会导致癌症等的突变基因。借助一小滴测试液,医生们能预测药物对病人的功效,可诊断出药物在治疗过程中的不良反应,还能当场鉴别出病人受到了何种细菌、病毒或其他微生物的感染。

Q:如果EGFR野生型,该用什么药?

建议做KRAS检测,美国国立综合癌症网络将KRAS作为部分癌症的常规检查,这就包括非小细胞肺癌,KRAS突变与EGFR突变几乎是不会发生在同一个非小细胞肺癌患者身上的。Selumetinib联合多西他赛对肺癌有临床治疗意义。 具体商品名还要咨询就诊肿瘤科医生。 任何用需要详细制定用药策略,减少耐药性的发生。

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