你好，肺脓肿属于化脓性感染疾病，而肺囊肿属于先天性的发育异常。在治疗上，肺脓肿只要对症用药是可以治愈的，而肺囊肿一般药物不能治愈，手术切除才能根治。

肺囊肿又称支气管囊肿，系稍晚期发生的支气管肺局限性发育异常，它以支气管组织为囊壁、内含黏液的先天性囊肿。少数后天性囊肿由于肺脓肿和结核性空洞愈合后腔内覆被上皮而形成。先天性肺囊肿有单发和多发两种。肺囊肿根据与支气管连通情况分为含液囊肿(闭合性囊肿)、液气囊肿、含气囊肿(开放性囊肿)。

肺囊肿的治疗：治疗：(一)治疗原则肺囊肿易并发感染、出血、肺炎、张力性气胸、胸膜炎等，明确诊断后，不论囊肿大小都应采取积极的外科治疗。有感染症状者应在控制中毒症状后再行肺囊肿的手术处理。(二)手术治疗l.手术禁忌证全身情况差，不能耐受手术;双侧肺多发肺囊肿。感染中毒症状严重应争取先行控制感染再行手术。2.手术要点较小、单发、靠近肺边缘的肺囊肿，肺囊肿的治疗可做楔形切除或肺段切除术。囊肿较大或多发性囊肿，可作肺叶切除，多发性肺囊种累及全肺的可考虑行一侧全肺切除。