HPV病毒对女性生育功能没有任何影响，但还是建议在怀孕之前做一个宫颈涂片，证明没有病毒感染造成的病变。因为如果携带HPV病毒，可能在怀孕期间造成一些病变，比如宫颈上皮内瘤变，在锥切以后容易造成流产。
HPV病毒可以感染胎儿，目前发现低危型HPV感染胎儿比较明显。感染途径主要有三种：一是母体产道里面有HPV感染的细胞，胎儿可能会吸入造成胎儿咽喉部HPV病毒感染，这种病毒容易恶变，不过发生率很低，比较罕见；另外还有研究称HPV病毒可以通过胎盘传给胎儿，即通过垂直传播，但是不引起孩子严重的病变；此外还可以通过羊水胎膜上行传播给胎儿。
HPV病毒不会遗传。这就是说胎儿刚生下来体内已经存在HPV病毒了。只是以后造成病变的几率不大，但实际上还是存在这有可能。另外，刚才说HPV病毒有一个潜伏期，现在没有造成病变，可能在之后会变现出来？
目前为止只发现低危型HPV病毒引起咽喉部的HPV病毒感染，影响孩子的呼吸系统，造成呼吸困难需要治疗，其它的没有发现。
如果女性在怀孕之前感染了HPV病毒或者在怀孕之中感染了病毒，都有可能传染给胎儿，因为是在生产过程中传染的。低危型HPV病毒可以在产道里面生长，如果很巨大的时候会造成产道梗阻，这时候一般来说建议剖宫产分娩胎儿，但是剖宫产的方式并不能避免孩子绝对不感染HPV病毒，对胎儿只是感染，对小孩的生长发育没有任何影响。
怀孕期HPV感染率比一般人会高一些，妊娠后有易感HPV的趋势。正常女性HPV感染率是5%—40%，而妊娠以后感染率可以上升到60%，因妊娠期内分泌物有改变，细胞的免疫功能降低，感染率高，特别是晚孕期的HPV感染阳性率高一些。国外有些人研究新生儿HPV感染率可以达50%—73%，国内没有看到这方面资料。但是真正给婴儿造成影响的很少见。
另外，感染HPV病毒以后一般不建议终止妊娠，因为它不像其它感染可能对胎儿造成一些影响，目前来说HPV对孩子生长发育没有影响。
