尽管肝脓肿病因发生着变化，但是肝脓肿总的发病率一直相对稳定。在美国，细菌性肝脓肿占80%，重复感染占另外的10%。阿米巴是10%患者的主要原因，真菌和其它微生物引起的肝脓肿不足10%，美国细菌性肝脓肿的发病率估计为8/10万人口到15 /10万人口，在医疗保健不健全的国家，无论细菌性还是阿米巴性肝脓肿的发病率都较高。例如，在马来西亚细菌性肝脓肿占全部住院病例的0.85%。
肝脓肿在全球的发病率
阿米巴感染多见于热带或亚热带地区的国家或卫生差的地方和精神病院。1975年美国疾病控制中心(CDC)登记报道的阿米巴病例为每10万人有1.3例。CDC每年记录3500例阿米巴病例，该资料可能低估了实际的发病人数。来自发展中国家的移民和游客有较高的发病率，而到热带地区旅游的美国游客也比当地永久性居民更容易患阿米巴病。据估测，在墨西哥、非洲、东南亚和南美，15% -30%的人受到阿米巴的侵染。可能由于获得部分免疫，当地居民比外来游客表现的症状要少。
肝脓肿是阿米巴病最常见的肠外表现。据报道肝脏阿米巴病占患病人群的3%-10 %。 DeBakey和Ochsner发现，与肠道疾病相关的肝脏受累的发病率为13.2%。有报道在阿米巴病流行严重的地区，肝脏受累的比率可达到40%。
无论性别和年龄，都可受两种类型肝脓肿的影响。近年来，患细菌性肝脓肿的男性略多于女性，此与早些时候的系列研究一致。40-60岁年龄组的人最容易发病，由于住院青年人的免疫抑制率较高，因此儿童代表一个特殊的群体。在来自Duke大学医学中心的系列研究中，所有6例化脓性肝脓肿病人的年龄均小于15岁，且均为男性。在过去几年中，洛杉矶年轻病人的男女之比一直接近2：1.年轻病人中这种性别分布的改变可能反映受艾滋病影响的结果。男性比女性更容易患阿米巴性肝脓肿，男女患病之比为9~10:1。病人一般比较年轻，20-50岁年龄组人群最容易发病。
最近几篇报道指出，小于3岁的儿童阿米巴肝脓肿的发病率明显增高。除与居住环境有关外，未见有任何特殊的种族易感性。类似的例子包括西南美的墨西哥裔美国人，以及久居的南非黑人与南非白人的对比。
