细胞癌变过程中出现的肿瘤抗原包括肿瘤特异性抗原(TSA)和肿瘤相关抗原(TAA) 。
(1)甲胎蛋白(AFP) : AFP是单链多肤，分子IR为70kD,糖含量为3%，其基因位于第4对染色体上，主要由胚胎肝脏和卵黄囊合成，胎儿胃肠道也有少量合成，自妊娠3周后合成减少，出生后含址很低。其蛋白部分由590个氨基酸组成，N端232氨基酸处与一条糖链相结合，由原发性肝细胞癌、继发性肝癌、胚胎性细胞瘤和良性活动性肝脏疾病产生的AFP，其糖链结构不同，由于在AFP分子糖基化的差异，对植物凝集素(如扁豆凝集素LCA和刀豆素A ConA)有不同的反应，从而可分出AFP不同的异质体，LCA结合AFP更能反映肝组织再生情况，在肝癌时此类AFP异质体明显升高，从而有利于良性病变及肝癌鉴别诊断和早期发现。
(2)癌胚抗原(CEA):为分子量200kI、的糖蛋白，由胎儿能分泌多糖一蛋白质复合物的腺管上皮细胞合成。属于免疫球蛋白超家族的一员。偶见于正常成人细胞及良性上皮性肿瘤组织，而在许多癌组织中则有大量表达，这些肿瘤包括胃肠道及胰腺腺痛、肺癌及甲状腺髓样痛等。
在妊期3个月胎儿消化道、胰腺及肝组织中均有此抗原的表达a免疫组化中应用单克隆抗体比应用多克隆抗体有更高的特异性。由于该抗原可由肿瘤细胞分泌于血液之中，因此可做为肿瘤治疗与复发的监测物。Primus等以几种单克隆抗体( McAb)与结肠癌CEA特异结合，用免疫组织化学方法以及生物素免疫过氧化物酶法测定结肠癌的CEA，他们发现，在正常结肠的粘膜中，以染色法证实，位于肠腺窝和枯膜表面的柱状细胞中存在CEA，而杯状细胞(也就是分泌细胞)中则不存在CEA;而70%的结肠腺癌(即杯状细胞恶变)的细胞中则有CEA存在。这就可以区别结肠癌细胞和正常杯状细胞，从而对于临床的诊断和预后有很大的帮助。
(3)组织多肤抗原(TPA)和特异性组织多肤抗原(TPS ):是1957年由瑞典Bjorklund从各种肿瘤组织中分离出来的一种不含糖和脂的蛋白质，也是单链多肤，分子量范围在17 - 45kD，其结构与细胞角蛋白，和细胞骨架蛋白类似特别是与中角蛋白同源性较高，目前认为是一个增殖分化的标志，主要在消化道肿瘤、乳腺癌、泌尿系统肿瘤和呼吸道肿瘤中升高，一般情况下TPA与肿瘤恶化程度或预后呈负相关，TPA也是一种广谱性的肿瘤标志，其组织器官特异性不强，但敏感性较高。特异性组织多肤抗原(TPS)与TPA不同，TPS与细胞角蛋白无关，仅与细胞增殖有关。此外，还应用TPA的放射免疫显像，进行肿瘤局部定位诊断，因为核素标记的抗TPA和'FPS的抗体主要在肿瘤坏死区，现已应用于临床。
(4)CA15一3和粘蛋白样癌相关抗原:CA15一3是一种分子量约为40万的搪蛋白，主要是乳腺癌的标志。临床应用发现除乳腺癌外，卵巢癌、肺腺癌等，以及不少良性乳腺疾病，血清CA15 - 3也可超过正常。CAI5一3诊断乳腺癌的灵敏度虽达86%---87%，但特异性很低，而CA15 - 3用于乳腺癌的预后判断和疗效监察尚有一定价值。枯蛋白样癌相关抗原(MCA)是35万分子量的糖蛋白，正常上皮仅含少量，而乳腺癌中则大量存在，乳腺庙以外的卵巢癌和胃肠道癌也可见血清MCA上升，且良性乳腺疾患和其他良性疾病如肝炎等也可增高。目前主要应用于乳腺癌的病情追踪。
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(5)CA125抗原:这种抗原被人卵巢癌细胞系做免疫原制得的单抗所证实，是含有唾液酸成份的糖蛋白。对一些卵巢癌有较高的检出率，但缺乏专一性，肺、乳腺，甚至良性和恶性渗出液中CA125抗原也呈阳性。然而卵巢癌术后血清CA125水平明显降低。因此，常用作术后治疗效果和预后的监察指标。另外，CA125单抗可通过体内免疫闪烁技术，检出隐藏的卵巢癌转移灶。
(6)CA19一9: CA19一9是SW一1116人结肠癌抗原在小鼠中制成的单克隆抗体19一9所识别的抗原，已证明其结构为唾液酸化的I型乳糖系岩藻五糖，共由6个糖基组成，也即唾液酸化的Lewis a抗原。主要用于检测胰腺癌和消化道肿瘤。
(7)CA50和CA242:CA50是搪鞘脂抗原，即唾液酸化的I型乳糖系四糖。对胰腺癌、肝胆系统癌、结肠癌的阳性率分别为85%和80%,70%, CA242也是一种唾液酸化的鞘搪脂抗原，几乎总是和CA50一起表达，但两者受不同的单克隆抗体识别，主要也用于消化道和胰腺癌的病情监察。
